RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP1-205ENST00000466097 CXCL3P19876 107 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL12P30050 165 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 RGS21Q2M5E4 152 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 IGFL4Q6B9Z1 124 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 RNF182Q8N6D2 247 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP5SQ99766 215 aa10.72□□□□□ -0.69
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SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf45Q8TAV5 145 aa10.7□□□□□ -0.7
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SH3BP1-205ENST00000466097 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.69□□□□□ -0.7
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SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.68□□□□□ -0.7
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SH3BP1-205ENST00000466097 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf94C9JXX5 98 aa10.63□□□□□ -0.71
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SH3BP1-205ENST00000466097 AQP10Q96PS8 301 aa10.63□□□□□ -0.71
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