RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	DLX6	P56179	175 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TPPP2	P59282	170 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		Q6P435	159 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LCN15	Q6UWW0	184 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR4X1	Q8NH49	305 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LMX1A	Q8TE12	382 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CCL17	Q92583	94 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR82	Q96P67	336 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TP53RK	Q96S44	253 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	COL4A2	P08572	1712 aa		3.75	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LTBP2	Q14767	1821 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		H3BP45	60 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		J3QLI3	93 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SYNGR1	O43759	233 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2J2	O76002	312 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV3-1	P01715	115 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IL4	P05112	153 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXA6	P31267	233 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ERVS71-1	P61550	626 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MSMO1	Q15800	293 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	HIST3H3	Q16695	136 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	C10orf128	Q5T292	105 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		Q6ZS49	121 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FA2H	Q7L5A8	372 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PRNT	Q86SH4	94 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00596	Q86U02	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IMMP2L	Q96T52	175 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	RNF5	Q99942	180 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	NAGK	Q9UJ70	344 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		3.74	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	OR6C6	A6NF89	314 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378		F6UZH7	168 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SYNGR2	O43760	224 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PDE6D	O43924	150 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MT-CO2	P00403	227 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	KRAS	P01116	189 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	GYPA	P02724	150 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CD99	P14209	185 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	RUNX1	Q01196	453 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PRDX4	Q13162	271 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PIGY	Q3MUY2	71 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM27B	Q5VT28	67 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	RPRM	Q9NS64	109 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FUT9	Q9Y231	359 aa		3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	C17orf51	A8MQB3	221 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	DLEU1	O43261	78 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	CXorf1	O96002	111 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	TYMS	P04818	313 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SERPINA7	P05543	415 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	COX5B	P10606	129 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	IAPP	P10997	89 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	COX19	Q49B96	90 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	NMS	Q5H8A3	153 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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