RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	HKR1	P10072	659 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CNTFR	P26992	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNB1	P62873	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	BLCAP	P62952	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SP6	Q3SY56	376 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q6ZSV7	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RITA1	Q96K30	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	THYN1	Q9P016	225 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	AKAP9	Q99996	3911 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE7	O76087	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CA2	P00918	260 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRAS	P01116	189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	HLA-DRB1	P01911	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGF1	P05019	195 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5G3	P0C626	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	VDAC1	P21796	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	EVI2A	P22794	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	BTC	P35070	178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	G6PC	P35575	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	EMP1	P54849	157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD164	Q04900	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAGE4	Q13068	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF266	Q14584	549 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FXYD3	Q14802	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	UPK2	O00526	184 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP5L	O75964	103 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	KBTBD11	O94819	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHG2	P01859	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAB5A	P20339	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	CX3CL1	P78423	397 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSD52	Q0P140	79 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM187	Q14656	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q8N2B8	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ECHDC1-208	ENST00000436638	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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