RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SFTA3P0C7M3 94 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRYBA4P53673 196 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 B2MP61769 119 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCS1P62166 190 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 CD300CQ08708 224 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 BTN1A1Q13410 526 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 FHL2Q14192 279 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 PATE2Q6UY27 113 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC190Q86UF4 302 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 Q9HAA7 133 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A087X0K7 114 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNURFLB1AK76 121 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 H3BP45 60 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 K7EQD1 137 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAX4O43316 350 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPINK4O60575 86 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 OXTP01178 125 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGLV2-8P01709 118 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 CRYGDP07320 174 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERCC8Q13216 396 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 NFE4Q86UQ8 179 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 TERB2Q8NHR7 220 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 YIPF6Q96EC8 236 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 U3KQ87 197 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 E5RGE8 158 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 H3BQ15 152 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 PITX3O75364 302 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATG12O94817 140 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 RAB3DO95716 219 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 APOA1P02647 267 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF415Q09FC8 603 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SMCO1Q147U7 214 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR107Q5VW38 600 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF479Q96JC4 524 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 MIXL1Q9H2W2 232 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR132Q9UNW8 380 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 GABARAPH6UMI1 98 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 M0R3E3 92 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 WRBO00258 174 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADAP1O75689 374 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 GABARAPO95166 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNFAIP8O95379 198 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV3-30P01768 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV3-33P01772 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR5G3P0C626 314 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC00869P0C866 280 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 GYPEP15421 78 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 TCL1AP56279 114 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 VBP1P61758 197 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 AKR1C1Q04828 323 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC38A11Q08AI6 406 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM229BQ8NBD8 167 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 OR1S1Q8NH92 325 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC00477Q96M19 166 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 C20orf144Q9BQM9 153 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC45A2Q9UMX9 530 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0B4J2A0 478 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLLNB2CW77 178 aa3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 198.7 ms