RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365200.1

RNU6-1175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PSME3P61289 254 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FXYD3Q14802 87 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 XAF1Q6GPH4 301 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C5orf56Q8N8D9 126 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR4K15Q8NH41 348 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARL5AQ9Y689 179 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HERC1Q15751 4861 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TGP01266 2768 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NUP98P52948 1817 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DSPPQ9NZW4 1301 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A087WSZ3 146 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A096LPI6 279 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SULT1C4O75897 302 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 APOEP02649 317 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C1QBP02746 253 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EVI2AP22794 236 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 COX6A2Q02221 97 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR2F1Q13607 317 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NEDD8Q15843 81 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IMPG1Q17R60 797 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C22orf39Q6P5X5 142 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FOXI2Q6ZQN5 318 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR6V1Q8N148 313 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C10orf111Q8N326 155 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LRRC18Q8N456 261 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR10AG1Q8NH19 301 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PTH2Q96A98 100 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LINC00467Q9BRT7 94 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NPCDR1Q9BY65 106 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C20orf27Q9GZN8 174 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ATRQ13535 2644 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CEP164Q9UPV0 1460 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRAV27A0A087WT01 109 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A0G2JMM0 328 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A1W2PPB8 328 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 hADV38S2A0JD32 116 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 hDV103S1A0JD37 113 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C17orf112F2Z3M2 114 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TAX1BP3O14907 124 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DEXIO95424 95 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CALB1P05937 261 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CXCL1P09341 107 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ETV6P41212 452 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SULT1A1P50225 295 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RAB5CP51148 216 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PIGPP57054 158 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UBE2BP63146 152 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AESQ08117 197 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 Q6Q795 121 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR5D16Q8NGK9 328 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CT55Q8WUE5 264 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DCUN1D1Q96GG9 259 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HYLS1Q96M11 299 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR52E6Q96RD3 313 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 POPDC3Q9HBV1 291 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NAT8BQ9UHF3 227 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAT1Q14517 4588 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TTRP02766 147 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR10J4P0C629 311 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OCM2P0CE71 109 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PHBP35232 272 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ATP5G3P48201 142 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DYNLT3P51808 116 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RANP62826 216 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RRN3P1Q2M238 152 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM151BQ6UXP7 276 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C2orf50Q96LR7 162 aa-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms