RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 PAX9P55771 341 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 H7C423 109 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CDCP2Q5VXM1 449 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV3-1P01715 115 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CDKN1AP38936 164 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 VGLL1Q99990 258 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 DEFB108AA8MXU0 73 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 F8WEM9 126 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 Q86TA4 180 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 A4D1N5 150 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 I3L3M4 83 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ALKBH6Q3KRA9 238 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF664Q8N3J9 261 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 RFESDQ8TAC1 157 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 GUSBP1Q15486 140 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 MSGN1A6NI15 193 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 LILRA1O75019 489 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 INSP01308 110 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 C3orf79P0CE67 100 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF329Q86UD4 541 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ODF3Q96PU9 254 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 PTPRSQ13332 1948 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ATRXP46100 2492 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 SS18Q15532 418 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 TEN1Q86WV5 123 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 MED13Q9UHV7 2174 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 Q6Q795 121 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 DUX5Q96PT3 197 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 PRSS22Q9GZN4 317 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CDK2AP2O75956 126 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 IGF2-ASQ6U949 168 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 KAAG1Q9UBP8 84 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 PSG1P11464 419 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 TFF3Q07654 80 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ERCC8Q13216 396 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FAM168AQ92567 244 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC140Q96MF4 163 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 A0A087WX48 190 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 NPC2P61916 151 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2BP63146 152 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 DSCAMO60469 2012 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 hADV29S1A0JD25 119 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CD28P10747 220 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 PAX8Q06710 450 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 WNT10AQ9GZT5 417 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 SDK1Q7Z5N4 2213 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFB1O75438 58 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP2Q6ZN57 461 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CLUHP3Q96NS8 147 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 METRNQ9UJH8 293 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 K7ENP7 123 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ECSCRQ19T08 205 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 MIR17HGQ75NE6 70 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 DSCR8Q96T75 97 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 IGHV1-69P01742 117 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 MRAPQ8TCY5 172 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 NABP1Q96AH0 204 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 HRKO00198 91 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 ZAR1Q86SH2 424 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRD-201ENST00000355233 LTAP01374 205 aa4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 223.1 ms