RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 RANP62826 216 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa20.75■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PRE2 83 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 C17orf77Q96MU5 243 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 VAX2Q9UIW0 290 aa20.74■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB19A4D1S5 217 aa20.73■□□□□ 0.91
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CTDNEP1-201ENST00000318988 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa20.73■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM74A7A6NL05 159 aa20.73■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAFAH1B2P68402 229 aa20.73■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 PEA15Q15121 130 aa20.73■□□□□ 0.91
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF253O75346 499 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD33P20138 364 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB114Q30KQ6 69 aa20.72■□□□□ 0.91
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TXNDC17Q9BRA2 123 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC50A1Q9BRV3 221 aa20.72■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf94C9JXX5 98 aa20.71■□□□□ 0.91
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SAMD13Q5VXD3 122 aa20.71■□□□□ 0.91
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CTDNEP1-201ENST00000318988 Q9H3A6 140 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 WNK1Q9H4A3 2382 aa20.71■□□□□ 0.91
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC17A3O00476 420 aa20.7■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFB4O95168 129 aa20.7■□□□□ 0.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PGPA6NDG6 321 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A6AQ9H2W1 248 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TREM1Q9NP99 234 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ICAM4Q14773 271 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 WFDC3Q8IUB2 231 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV25A0A0B4J276 109 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5G3P48201 142 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFPI2P48307 235 aa20.68■□□□□ 0.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf66Q5T8R8 295 aa20.67■□□□□ 0.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SMDT1Q9H4I9 107 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC5AQ9NY25 188 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPAN4O14817 238 aa20.66■□□□□ 0.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 INSL3P51460 131 aa20.66■□□□□ 0.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 COL6A5A8TX70 2615 aa20.66■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE6DO43924 150 aa20.65■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa20.65■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2K2Q8NGT1 345 aa20.65■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISLRO14498 428 aa20.64■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSN1S1P47710 185 aa20.64■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGFL4Q6B9Z1 124 aa20.64■□□□□ 0.9
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRELID1Q9Y255 219 aa20.64■□□□□ 0.9
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 C5orf17Q8NAS9 161 aa20.63■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 WFDC9Q8NEX5 89 aa20.63■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCANP1Q8TF63 244 aa20.63■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCEAL7Q9BRU2 100 aa20.63■□□□□ 0.89
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GUCA2BQ16661 112 aa20.63■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 LCN12Q6JVE5 192 aa20.63■□□□□ 0.89
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV2A0A0B4J234 112 aa20.62■□□□□ 0.89
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC28AQ8IWP9 274 aa20.62■□□□□ 0.89
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RPH3ALQ9UNE2 315 aa20.62■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4C46A6NHA9 309 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 K7EQG2 157 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOCS3O14543 225 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF182Q8N6D2 247 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPDR1Q9UM22 224 aa20.61■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEBPGP53567 150 aa20.6■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLA-DMBP28068 263 aa20.59■□□□□ 0.89
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