RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 RFNGQ9Y644 331 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SPP1P10451 314 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 M6PRP20645 277 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 KRTAP10-11P60412 298 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 RAB2AP61019 212 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SERF2P84101 59 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 FAM78BQ5VT40 261 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 LEMD1Q68G75 181 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SLC51BQ86UW2 128 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 BAP18Q8IXM2 172 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 MRAPQ8TCY5 172 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 GPR82Q96P67 336 aa8.17□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 TSPAN4O14817 238 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 MBP02144 154 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 GALR1P47211 349 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 RHOBP62745 196 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 MORN5Q5VZ52 161 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 FUT9Q9Y231 359 aa8.16□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SEC11BP0C7V7 166 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 GUCA2BQ16661 112 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 TMEM41BQ5BJD5 291 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 OR4C46A6NHA9 309 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 K7EIL1 84 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 GP9P14770 177 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 TAS2R45P59539 299 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 PAFAH1B2P68402 229 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 KHDC3LQ587J8 217 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 TMED6Q8WW62 240 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 NRN1Q9NPD7 142 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.14□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 A0A087X0K7 114 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 A0A1W2PPV4 95 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 UMAD1C9J7I0 102 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 TFPI2P48307 235 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 MEOX2P50222 304 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 RPRMQ9NS64 109 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.13□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 ZNF785A8K8V0 405 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 K7EQG2 157 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 OR7C2O60412 319 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 IGLC2P0DOY2 106 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 DCANP1Q8TF63 244 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 PHYHIPLQ96FC7 376 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 PRR25Q96S07 402 aa8.12□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 SOCS3O14543 225 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 PYYP10082 97 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 CD81P60033 236 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 LCN15Q6UWW0 184 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 DPPA3Q6W0C5 159 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 RAB24Q969Q5 203 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 PAXXQ9BUH6 204 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 HRH4Q9H3N8 390 aa8.11□□□□□ -1.11
CTIF-204ENST00000587769 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 804.4 ms