RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	C16orf92	Q96LL3	132 aa		15.69	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0J9YX75	114 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HYPM	O75409	117 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HLA-DMB	P28068	263 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TEPP	Q6URK8	271 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	GGACT	Q9BVM4	153 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DEDD	O75618	318 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF846	Q147U1	533 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM78B	Q5VT40	261 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	NEU1	Q99519	415 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RPRM	Q9NS64	109 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		15.68	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MTW9	85 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf94	C9JXX5	98 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FXYD7	P58549	80 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RAP2B	P61225	183 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PATE2	Q6UY27	113 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	S100Z	Q8WXG8	99 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	UHRF2	Q96PU4	802 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	CELA1	Q9UNI1	258 aa		15.67	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		15.66	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM25E	A8MYX2	175 aa		15.66	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	PSG9	Q00887	426 aa		15.66	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	IL15RA	Q13261	267 aa		15.66	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	ASAH1	Q13510	395 aa		15.66	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZTC4	211 aa		15.66	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		15.65	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TCTA	P57738	103 aa		15.65	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	AMTN	Q6UX39	209 aa		15.65	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf50	Q96LR7	162 aa		15.65	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	15.65	■□□□□ 0.1
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf51	A6NDU8	294 aa		15.64	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	AGPAT2	O15120	278 aa		15.64	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5G3	P0C626	314 aa		15.64	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		15.64	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL6	Q9H0F7	186 aa		15.64	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200		L7N2F9	121 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	VAMP2	P63027	116 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	C12orf74	Q32Q52	190 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF546	Q86UE3	836 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	MGST2	Q99735	147 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ARV1	Q9H2C2	271 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	APLN	Q9ULZ1	77 aa		15.63	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087X0K7	114 aa		15.62	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		15.62	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF182	Q8N6D2	247 aa		15.62	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		15.61	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLL5	B9A064	214 aa		15.61	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	GOSR2	O14653	212 aa		15.61	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A7A	Q86SG5	101 aa		15.61	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		15.61	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	UPK1B	O75841	260 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CAV2	P51636	162 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	FGL1	Q08830	312 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CST7	O76096	145 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAP31	P51572	246 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IFITM3	Q01628	133 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	VWC2	Q2TAL6	325 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RFNG	Q9Y644	331 aa		15.6	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		15.59	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM189	A5PLL7	270 aa		15.59	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCL3	P19876	107 aa		15.59	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB32	Q13637	225 aa		15.59	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		15.59	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		15.59	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF24	Q9Y225	148 aa		15.59	■□□□□ 0.09
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	15.58	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	15.58	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		15.58	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	IGSF23	A1L1A6	192 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMLG	P49069	296 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT1A1	P50225	295 aa		15.57	■□□□□ 0.08

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