RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.91□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GVY2 172 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2CO00762 179 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 CLN5O75503 358 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00869P0C866 280 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 FOLR2P14207 255 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 NPBWR1P48145 328 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 FHITP49789 147 aa6.9□□□□□ -1.3
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SMAD3-215ENST00000560424 RAB2AP61019 212 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 B2MP61769 119 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 MLANAQ16655 118 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 STPG3Q8N7X2 389 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 NECAP1Q8NC96 275 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 SUN5Q8TC36 379 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 NPIPB3Q92617 1050 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 MISP3Q96FF7 219 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.9□□□□□ -1.3
SMAD3-215ENST00000560424 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 FAM223BA6NKX1 122 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 IGLL5B9A064 214 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 SCGB2A1O75556 95 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 YIF1AO95070 293 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 FABP1P07148 127 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 IGLC1P0CG04 106 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 OR10J1P30954 320 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 RND2P52198 227 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF726P1Q15940 193 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 TM4SF20Q53R12 229 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 MIC13Q5XKP0 118 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ACY3Q96HD9 319 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 RNF2Q99496 336 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 VSIRQ9H7M9 311 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 RFNGQ9Y644 331 aa6.89□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf70A6NJV1 201 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP92A6NM28 416 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 F8W735 103 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV1-17P01599 117 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 OR5G3P0C626 314 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 APELAP0DMC3 54 aa6.88□□□□□ -1.31
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SMAD3-215ENST00000560424 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 FAM209BQ5JX69 171 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 PFDN5Q99471 154 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 HRH4Q9H3N8 390 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 PKHD1P08F94 4074 aa6.88□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 BMPR1BO00238 502 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 OR2C1O95371 312 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 CD5P06127 495 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 STAG3L2P0CL84 134 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 STAG3L3P0CL85 134 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 RHOBP62745 196 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ATP5G2Q06055 141 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 RAB24Q969Q5 203 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.87□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PPV4 95 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF320A2RRD8 509 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 OR2J3O76001 311 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 TOMM40O96008 361 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 CBLN1P23435 193 aa6.86□□□□□ -1.31
SMAD3-215ENST00000560424 PSMB3P49720 205 aa6.86□□□□□ -1.31
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