RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558376.5

RABGGTA-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-204ENST00000558376 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 CLEC3BP05452 202 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 GUK1Q16774 197 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 TRGV9Q99603 122 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 TREM1Q9NP99 234 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 THYN1Q9P016 225 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 GNG13Q9P2W3 67 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTA-204ENST00000558376 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 RAB19A4D1S5 217 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 GNG7O60262 68 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 IGLV1-51P01701 117 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 APOC3P02656 99 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 CTSGP08311 255 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 OR5G3P0C626 314 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 RD3LP0DJH9 198 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 MFAP4P55083 255 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM68Q96MH6 324 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 PRELID1Q9Y255 219 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TRGV3P03979 118 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 CD5P06127 495 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 LEMD1Q68G75 181 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 UQCC3Q6UW78 93 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 NECAP1Q8NC96 275 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 SPATA25Q9BR10 227 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 PBDC1Q9BVG4 233 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 GPR183P32249 361 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ADMP35318 185 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 NPBWR1P48145 328 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 RHOBP62745 196 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 RXFP4Q8TDU9 374 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 PPP5D1E7EU14 171 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 COX7A2P2O60397 106 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 HBE1P02100 147 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 STAG3L2P0CL84 134 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 STAG3L3P0CL85 134 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TPPP2P59282 170 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 UBE2G2P60604 165 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 LYZP61626 148 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 SELENOTP62341 195 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ATP5G2Q06055 141 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 KLK9Q2XQG4 91 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 OR51G1Q8NGK1 321 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF502Q8TBZ5 544 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF503Q96F45 646 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 CCDC140Q96MF4 163 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 RETNQ9HD89 108 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 KLK9Q9UKQ9 250 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 FUT9Q9Y231 359 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TMEM218A2RU14 115 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TRBV12-3P01733 135 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 OR10J4P0C629 311 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ADCYAP1P18509 176 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ICAM4Q14773 271 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 PAGE4O60829 102 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 HYPMO75409 117 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 IL4P05112 153 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 PPT1P50897 306 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 CEBPGP53567 150 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 SFTA3P0C7M3 94 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 PYYP10082 97 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 PEA15Q15121 130 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 OR7C2O60412 319 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 CXorf1O96002 111 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 TOMM40O96008 361 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 C8orf88P0DMB2 117 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 GCHFRP30047 84 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 F8W036 122 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 H3BTX0 84 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTA-204ENST00000558376 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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