RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TEPPQ6URK8 271 aa9.6□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa9.6□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C20orf173Q96LM9 149 aa9.6□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 XCL2Q9UBD3 114 aa9.6□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 F6UB75 175 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HYPMO75409 117 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DEDDO75618 318 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGKV3-20P01619 116 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR5G3P0C626 314 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BCAP31P51572 246 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FXYD7P58549 80 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PATE2Q6UY27 113 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FOXI2Q6ZQN5 318 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C11orf45Q8TAV5 145 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C16orf92Q96LL3 132 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UHRF2Q96PU4 802 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GGACTQ9BVM4 153 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HIGD1AQ9Y241 93 aa9.59□□□□□ -0.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AGPAT2O15120 278 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CST7O76096 145 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MIFP14174 115 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MEOX2P50222 304 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RAP2BP61225 183 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RAB32Q13637 225 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ENKURQ8TC29 256 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GPR82Q96P67 336 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARL6Q9H0F7 186 aa9.58□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 A0A0J9YX75 114 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GOSR2O14653 212 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 S100A7P31151 101 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CAV2P51636 162 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 S100A10P60903 97 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR4B1Q8NGF8 309 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLUHP3Q96NS8 147 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MGST2Q99735 147 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPRMQ9NS64 109 aa9.57□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGSF23A1L1A6 192 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SIX6O95475 246 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FGL1Q08830 312 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FAM78BQ5VT40 261 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF709Q8N972 641 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MFFQ9GZY8 342 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC35B3Q9H1N7 401 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARV1Q9H2C2 271 aa9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPL7P18124 248 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF546Q86UE3 836 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RNF182Q8N6D2 247 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LINC00476Q8WZB0 136 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BATF3Q9NR55 127 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.55□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 A0A087X0K7 114 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HLA-DMBP28068 263 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SULT1A1P50225 295 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PSG9Q00887 426 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 VWC2Q2TAL6 325 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LINC00305Q7Z4B0 112 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM37Q8WXS4 190 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MARVELD1Q9BSK0 173 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HRH4Q9H3N8 390 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.54□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 A8MTW9 85 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRAF2O60831 178 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LY6G6CO95867 125 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 S100A11P31949 105 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CAMLGP49069 296 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MORN5Q5VZ52 161 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MIC13Q5XKP0 118 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AMTNQ6UX39 209 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 S100A7AQ86SG5 101 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CELA1Q9UNI1 258 aa9.53□□□□□ -0.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 COX7A2P2O60397 106 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.2 ms