RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 PITX3O75364 302 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 CDK2AP2O75956 126 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 CCL18P55774 89 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 GPR141Q7Z602 305 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 RNF182Q8N6D2 247 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.93□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.92□□□□□ -0.5
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CS-214ENST00000548849 SMIM18P0DKX4 95 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 AZU1P20160 251 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 S100A7P31151 101 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 ATP5G3P48201 142 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 RPP30P78346 268 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 SPCS2Q15005 226 aa11.92□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 BAP18Q8IXM2 172 aa11.92□□□□□ -0.5
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CS-214ENST00000548849 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 WRBO00258 174 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 MED6O75586 246 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 TSPOP30536 169 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 TMED4Q7Z7H5 227 aa11.91□□□□□ -0.5
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CS-214ENST00000548849 LINC01587Q99440 93 aa11.91□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 CBY3A6NI87 242 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 HTN1P15515 57 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 RHOBP62745 196 aa11.9□□□□□ -0.5
CS-214ENST00000548849 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa11.9□□□□□ -0.5
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CS-214ENST00000548849 PRSS46E5RG02 174 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SYNGR2O43760 224 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SLC25A6P12236 298 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 AKR1C1Q04828 323 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 CLINT1Q14677 625 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.89□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 VAMP1P23763 118 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 RNF141Q8WVD5 230 aa11.88□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 H3BP45 60 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 H3BRN7 92 aa11.87□□□□□ -0.51
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CS-214ENST00000548849 TAS2R60P59551 318 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 RAP2BP61225 183 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SSX7Q7RTT5 188 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.87□□□□□ -0.51
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CS-214ENST00000548849 LRRC20Q8TCA0 184 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 C16orf74Q96GX8 76 aa11.87□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SMCO3A2RU48 225 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 FABP12A6NFH5 140 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 IL5P05113 134 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 HOXB5P09067 269 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 Q9H8V8 135 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 Q8N1X5 172 aa11.85□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 HYPMO75409 117 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SFT2D2O95562 160 aa11.84□□□□□ -0.51
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CS-214ENST00000548849 CXCL3P19876 107 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 TNFSF8P32971 234 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 OR5I1Q13606 314 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 PSG3Q16557 428 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 UHRF2Q96PU4 802 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SOSTQ9BQB4 213 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 SCRT2Q9NQ03 307 aa11.84□□□□□ -0.51
CS-214ENST00000548849 LINC00869P0C866 280 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 CDKN1BP46527 198 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 TOMM5Q8N4H5 51 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.83□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 AP3S2P59780 193 aa11.82□□□□□ -0.52
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