RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ECSCRQ19T08 205 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 S100A7AQ86SG5 101 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 Q96MF0 132 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 Q9H3A6 140 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 F8P00451 2351 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF320A2RRD8 509 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 S100A8P05109 93 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 GNG5P63218 68 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 ATG101Q9BSB4 218 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 RNF24Q9Y225 148 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF98A6NK75 572 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01548A6NM66 108 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-23P01764 117 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 AMY1AP04745 511 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CTSGP08311 255 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IGLC2P0DOY2 106 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GATA3P23771 443 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2G1P62253 170 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RPEL1Q2QD12 228 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM219Q86XT9 240 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 BAGE2Q86Y30 109 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM12Q96EX1 92 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 OTORQ9NRC9 128 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 A0A096LNT2 108 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 OR2T8A6NH00 312 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 G3V318 75 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 H3BTX0 84 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TCRAP04437 139 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CR1P17927 2039 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 C15orf32Q32M92 178 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 HIF1ANQ9NWT6 349 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MTORP42345 2549 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ADMP35318 185 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RHOGP84095 191 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 FMC1Q96HJ9 113 aa6.39□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RNF223E7ERA6 249 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 AVPP01185 164 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MEOX2P50222 304 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CTAG1AP78358 180 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GPR82Q96P67 336 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MLST8Q9BVC4 326 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 A6NDX4 124 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 IFITM10A6NMD0 228 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 LTAP01374 205 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 PDE6HQ13956 83 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 C12orf57Q99622 126 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.38□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 H3BUX3 64 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM6P0DI80 62 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 GPR183P32249 361 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC140Q96MF4 163 aa6.37□□□□□ -1.39
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