RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 HLA-DMBP28068 263 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC25A1P53007 311 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 MTPNP58546 118 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 KRTDAPP60985 99 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 QRFPP83859 136 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00303Q3SY05 128 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 ETDBQ3ZM63 59 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTB-214ENST00000497648 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 AQP3Q92482 292 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 AICDAQ9GZX7 198 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-214ENST00000497648 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTB-214ENST00000497648 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTB-214ENST00000497648 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
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RABGGTB-214ENST00000497648 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 ELK1P19419 428 aa6.96□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 PCTPQ9UKL6 214 aa6.96□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 PRR32B1ATL7 298 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 CBLN1P23435 193 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 GFERP55789 205 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 CDK5R1Q15078 307 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 TEN1Q86WV5 123 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 LINC00479Q96M42 142 aa6.94□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 OTORQ9NRC9 128 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 KLK13Q9UKR3 277 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 SPTA1P02549 2419 aa6.93□□□□□ -1.3
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RABGGTB-214ENST00000497648 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 LRTM2Q8N967 370 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 BRK1Q8WUW1 75 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 FGF11Q92914 225 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 KCNS1Q96KK3 526 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 FAM60AQ9NP50 221 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGGTB-214ENST00000497648 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.93□□□□□ -1.3
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