RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475240.5

ABCD4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 5

Gene ABCD4, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-208	ENST00000475240	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240		H3BRN7	92 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	RAP2B	P61225	183 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	FGL1	Q08830	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	HYPM	O75409	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	LINC00869	P0C866	280 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240		P0DMU3	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	FAM231A	P0DMU4	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	FAM231C	P0DMU5	169 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	BTC	P35070	178 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	DLK1	P80370	383 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	DKK2	Q9UBU2	259 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240		A8MTW9	85 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	CCNK	O75909	580 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	OR5G3	P0C626	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	SELENOT	P62341	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	RRN3P1	Q2M238	152 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	RNF182	Q8N6D2	247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	IL7	P13232	177 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	S100A7A	Q86SG5	101 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	ZNF738	Q8NE65	137 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ABCD4-208	ENST00000475240	PLP1	P60201	277 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	UHRF2	Q96PU4	802 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	FNDC10	F2Z333	226 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240		M0R2Z0	102 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	TSC22D2	O75157	780 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	INS	P01308	110 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	HTN3	P15516	51 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	TAS2R30	P59541	319 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	FAM210B	Q96KR6	192 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	ARL6	Q9H0F7	186 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	OXA1L	Q15070	435 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240		K7EPK0	472 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	DAD1	P61803	113 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	ZNF546	Q86UE3	836 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	RNF24	Q9Y225	148 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240		A0A087X0K7	114 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	GOSR2	O14653	212 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	ARV1	Q9H2C2	271 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	C7orf66	A4D0T2	115 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240		L7N2F9	121 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	CCS	O14618	274 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	CXCL3	P19876	107 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	RHOB	P62745	196 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	VAMP2	P63027	116 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	PATE2	Q6UY27	113 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ABCD4-208	ENST00000475240	AGPAT2	O15120	278 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ABCD4-208	ENST00000475240	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23

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