RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 M0R381 172 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 THAP8Q8NA92 274 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 C10orf105Q8TEF2 133 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 RAX2Q96IS3 184 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PEMTQ9UBM1 199 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 SYT8Q8NBV8 401 aa7.96□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PROP1O75360 226 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 RNF182Q8N6D2 247 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GUT8 65 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BKO60814 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BJP06899 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BOP23527 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BBP33778 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BDP58876 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BCP62807 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 ERCC8Q13216 396 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 FCER1GP30273 86 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PTPRBP23467 1997 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 CGB3P0DN86 165 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 CGB7P0DN87 165 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 FBLN7Q53RD9 439 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 USMG5Q96IX5 58 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.95□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 TSPOP30536 169 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PSG3Q16557 428 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 NPBQ8NG41 125 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 GGTLC3B5MD39 225 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 IGLV1-47P01700 117 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 ASIPP42127 132 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PRR20EP86478 221 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PRR20CP86479 221 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PRR20DP86480 221 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PRR20BP86481 221 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PRR20AP86496 221 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 NBASA2RRP1 2371 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PSMG4Q5JS54 123 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 LCN12Q6JVE5 192 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 A0A087X0M5 115 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GX30 115 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 M0R3E3 92 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 IGLC1P0CG04 106 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 TSKUQ8WUA8 353 aa7.94□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 FOLR2P14207 255 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 OVOL3O00110 214 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 IGHV4-59P01825 116 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF114Q8NC26 417 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 C8orf49Q96NF6 230 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 H3BRN7 92 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 P0C879 139 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 ATOH7Q8N100 152 aa7.93□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 SH2D1AO60880 128 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 HOXA5P20719 270 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 Q6ZN92 141 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 KCNS1Q96KK3 526 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 PRELID3AQ96N28 172 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 SIRPDQ9H106 197 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 J3QLI3 93 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF56Q15929 161 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 Q86TA4 180 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 FXYD5Q96DB9 178 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 SERF1AO75920 110 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 LEPROTL1O95214 131 aa7.92□□□□□ -1.14
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms