RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 C20orf173Q96LM9 149 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00052Q96N35 136 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 RSG1Q9BU20 258 aa10.91□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 E5RGE8 158 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 H3BMM0 161 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 RLN2P04090 185 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 HBG1P69891 147 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 HBG2P69892 147 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 CYCSP99999 105 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 NHLH2Q02577 135 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 BAXQ07812 192 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 MORN5Q5VZ52 161 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 GPR82Q96P67 336 aa10.9□□□□□ -0.66
CSAG1-201ENST00000361211 SACSQ9NZJ4 4579 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ISLRO14498 428 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 SPP1P10451 314 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DRB4P13762 266 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 FGF7P21781 194 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ID1P41134 155 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 OPCMLQ14982 345 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 IGFL4Q6B9Z1 124 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 GATAD1Q8WUU5 269 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM37Q8WXS4 190 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 C16orf92Q96LL3 132 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RARRES2Q99969 163 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RNF126Q9BV68 326 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.89□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 LYSTQ99698 3801 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 F6UB75 175 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 COX7A2P2O60397 106 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 MPC2O95563 127 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RPL7P18124 248 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 CXCL3P19876 107 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 S100A7P31151 101 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 MEOX2P50222 304 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PRR20EP86478 221 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PRR20CP86479 221 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PRR20DP86480 221 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PRR20BP86481 221 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PRR20AP86496 221 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 FGL1Q08830 312 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ATP6V1FQ16864 119 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 OR11H2Q8NH07 326 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A31Q9H0C2 315 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 CLEC5AQ9NY25 188 aa10.88□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 IGKV3-20P01619 116 aa10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RAB31Q13636 194 aa10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 CLINT1Q14677 625 aa10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 FOXI2Q6ZQN5 318 aa10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 IL17DQ8TAD2 202 aa10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 THAP6Q8TBB0 222 aa10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RYR3Q15413 4870 aa10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 A0A087X0K7 114 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DMBP28068 263 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RPL29P47914 159 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 B2MP61769 119 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 SAMD13Q5VXD3 122 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RNF182Q8N6D2 247 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 MBD2Q9UBB5 411 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.86□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 TRAV5A0A0B4J249 113 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 A0A0J9YX75 114 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 FXYD7P58549 80 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 FCN2Q15485 313 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM41BQ5BJD5 291 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 Q6ZRG5 221 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 S100A7AQ86SG5 101 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 OR11H7Q8NGC8 314 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 CHAC2Q8WUX2 184 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 RPRMQ9NS64 109 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 XCL2Q9UBD3 114 aa10.85□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 H3BTX0 84 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB4AO15263 64 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 PET100P0DJ07 73 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 GCSAMLQ5JQS6 135 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 FAM78BQ5VT40 261 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF709Q8N972 641 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 Q8NAQ8 132 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 OR4B1Q8NGF8 309 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 HSPB11Q9Y547 144 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 X6R8D5 127 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.84□□□□□ -0.67
CSAG1-201ENST00000361211 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 218.2 ms