RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 TCF24Q7RTU0 167 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 NHLRC2Q8NBF2 726 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 LRBAP50851 2863 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GXF2 115 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ENSAO43768 121 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 C8orf88P0DMB2 117 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 NUP35Q8NFH5 326 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 OR1L8Q8NGR8 309 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa14.86□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 M0R1W7 72 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 CIDEAO60543 219 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.85□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 LY6LH3BQJ8 138 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A17O43808 307 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 OR7C2O60412 319 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 LGALS7P47929 136 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 MOB3BQ86TA1 216 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 PTPN13Q12923 2485 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 GAGE12BA1L429 117 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 SEC11AP67812 179 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 RPEQ96AT9 228 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 NUDT11Q96G61 164 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.84□□□□□ -0.03
SPNS1-204ENST00000352260 OR2T8A6NH00 312 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 CGB1A6NKQ9 187 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 E7EUB6 86 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 OVOL3O00110 214 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 C2orf83Q53S99 150 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 HECTD1Q9ULT8 2610 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.83□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 TNCP24821 2201 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 ACTL6BO94805 426 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 PSG9Q00887 426 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 CT83Q5H943 113 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM238C9JI98 176 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 PRTN3P24158 256 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 KLRD1Q13241 179 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 HCP5Q6MZN7 132 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.82□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1W2PPI3 338 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 CORTO00230 105 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 LEPROTL1O95214 131 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 IGLC1P0CG04 106 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 CNTFRP26992 372 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 HBBP68871 147 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 MUC21Q5SSG8 566 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 TEX45Q8NA69 505 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 RNF24Q9Y225 148 aa14.81□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 CRYGBP07316 175 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 ERHP84090 104 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 FAM168AQ92567 244 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 DPF1Q92782 380 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 ODF3BA8MYP8 253 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 GOSR1O95249 250 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 HTR1DP28221 377 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 CEACAM3P40198 252 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 DPM3Q9P2X0 92 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 HSPB8Q9UJY1 196 aa14.8□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 WT1-ASQ06250 92 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 IGFBPL1Q8WX77 278 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 CLEC5AQ9NY25 188 aa14.79□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 HIGD1CA8MV81 97 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 PEX7O00628 323 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.78□□□□□ -0.04
SPNS1-204ENST00000352260 BPESC1Q9GZL8 116 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.8 ms