RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264107.11

ITGA6-201, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA6, Length 5,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-201ENST00000264107 IGLL5B9A064 214 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 CARD19Q96LW7 228 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 TMEM258P61165 79 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 TMEM86BQ8N661 226 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 FAM186AA6NE01 2351 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 NPYP01303 97 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 SYNJ2BPP57105 145 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 DUX5Q96PT3 197 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 FREM3P0C091 2139 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 A0A1W2PR77 199 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 C3orf56Q8N813 242 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 HLA-DMBP28068 263 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 PCP2Q8IVA1 136 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 RNF183Q96D59 192 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 TMEM42Q69YG0 159 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 CRYGSP22914 178 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.72□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 DUX3Q96PT4 197 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 VCYO14598 125 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 PAX4O43316 350 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 NDUFC2O95298 119 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 Q8TAT8 98 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.71□□□□□ -0.05
ITGA6-201ENST00000264107 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C21orf140B9A014 251 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 IGHG4P01861 327 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 SPXQ9BT56 116 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 DKK2Q9UBU2 259 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 LEPROTO15243 131 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 LINC00312Q9Y6C7 94 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C5orf63A6NC05 138 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 HAX1O00165 279 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 HLA-DRB4P13762 266 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 TRGV9Q99603 122 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 Q6ZS49 121 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 IL15RAQ13261 267 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 LINC00473A8K010 186 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 PRR33A8MZF0 331 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 TRGV3P03979 118 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 ZNF747Q9BV97 191 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 Q8N8P6 123 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 FOXI1Q12951 378 aa14.69□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 MYOD1P15172 320 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 PCOLCEQ15113 449 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C22orf46C9J442 243 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 SVILO95425 2214 aa14.68□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 K7EN84 100 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 RS1O15537 224 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 RFPL3SP0C7P2 107 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 COX6A1P12074 109 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 ZNF876PQ49A33 203 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 NDUFS7O75251 213 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 CCL3L1P16619 93 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 FOXC1Q12948 553 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.67□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 ESPL1Q14674 2120 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 TEN1Q86WV5 123 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 RASL10AQ92737 203 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 PRSS46E5RG02 174 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 DPM3Q9P2X0 92 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C5orf47Q569G3 176 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 RTTNQ86VV8 2226 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa14.66□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 LINC00205P59089 165 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 C11orf52Q96A22 123 aa14.65□□□□□ -0.06
ITGA6-201ENST00000264107 CECR9P0C854 216 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74 ms