RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261333.10

ZNF397-201, Transcript of zinc finger protein 397, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF397, Length 1,419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397-201ENST00000261333 SPP1P10451 314 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 HLA-DRB4P13762 266 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 ID1P41134 155 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 FXYD7P58549 80 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 SELENOTP62341 195 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 FGL1Q08830 312 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF546Q86UE3 836 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 C16orf92Q96LL3 132 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 GGACTQ9BVM4 153 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 OR5AC2Q9NZP5 309 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF397-201ENST00000261333 CXorf65A6NEN9 183 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 SULT1A1P50225 295 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 H2BFSP57053 126 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 PLP1P60201 277 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 RNF182Q8N6D2 247 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 ARV1Q9H2C2 271 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 XCL2Q9UBD3 114 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 ISLRO14498 428 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 SSNA1O43805 119 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 MORN5Q5VZ52 161 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 MIC13Q5XKP0 118 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 STX12Q86Y82 276 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 H0YIZ8 118 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 CAMLGP49069 296 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 BAXQ07812 192 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 FOXI2Q6ZQN5 318 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 NMES1Q9C002 83 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.62□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 COX7A2P2O60397 106 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 HLA-DMBP28068 263 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 MEOX2P50222 304 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 VWC2Q2TAL6 325 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 Q8NAQ8 132 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 TMEM37Q8WXS4 190 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 GPR82Q96P67 336 aa11.61□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 LCE6AA0A183 80 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 RPL7P18124 248 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 FGF7P21781 194 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 HBG1P69891 147 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 HBG2P69892 147 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 NHLH2Q02577 135 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 FAM78BQ5VT40 261 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 SLC35B3Q9H1N7 401 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 X6R8D5 127 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 H3BTX0 84 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 S100A7P31151 101 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 S100A11P31949 105 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 CLINT1Q14677 625 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 OPCMLQ14982 345 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF709Q8N972 641 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 THAP6Q8TBB0 222 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 RPRMQ9NS64 109 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 ALG5Q9Y673 324 aa11.6□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 A0A0J9YX75 114 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 E5RGE8 158 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 RBMY1CP0DJD4 496 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 PRR20EP86478 221 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 PRR20CP86479 221 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 PRR20DP86480 221 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 PRR20BP86481 221 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 PRR20AP86496 221 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 C10orf113Q5VZT2 155 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.59□□□□□ -0.55
ZNF397-201ENST00000261333 A0A087X0K7 114 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 TRAV5A0A0B4J249 113 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 RLN2P04090 185 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 B2MP61769 119 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 RAB31Q13636 194 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 EBLN2Q6P2I7 272 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF738Q8NE65 137 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 PXMP4Q9Y6I8 212 aa11.58□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 KMT2AQ03164 3969 aa11.57□□□□□ -0.56
ZNF397-201ENST00000261333 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms