RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL24Q5JXM2 366 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 TEKT1Q969V4 418 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa30.02■■■□□ 2.4
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM83AQ86UY5 434 aa30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 BTBD19C9JJ37 291 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS37DQ86XT2 251 aa30■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF6O14896 467 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR2O60603 784 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 ERO1BQ86YB8 467 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 WRNIP1Q96S55 665 aa29.99■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 CAVIN4Q5BKX8 364 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 USP44Q9H0E7 712 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 CETPP11597 493 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIL2Q13356 520 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.96■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
CAPNS1-216ENST00000628306 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 CTGFP29279 349 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 SNAPC2Q13487 334 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP290O15078 2479 aa29.93■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 SZT2Q5T011 3432 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 INPP5BP32019 993 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF6Q15052 776 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRA2Q96PE1 1338 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM27P14373 513 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 MOGSQ13724 837 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 C17orf99Q6UX52 265 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 NBPF11Q86T75 865 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF112Q9UJU3 913 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 MAST3O60307 1309 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 PPATQ06203 517 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRCP08575 1304 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-216ENST00000628306 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.89■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PANK1Q8TE04 598 aa29.89■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.89■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.89■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.89■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 EYA2O00167 538 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 NFIAQ12857 509 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF15Q66K64 600 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM151AQ8WW52 585 aa29.88■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SHISA4Q96DD7 197 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 HOOK2Q96ED9 719 aa29.87■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 GNRH1P01148 92 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 RLBP1P12271 317 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD23Q86SG2 305 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 LPIN2Q92539 896 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM47Q96LD4 638 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM198AQ9UFP1 575 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CPA4Q9UI42 421 aa29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDX5P30044 214 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 COG6Q9Y2V7 657 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ATRNL1Q5VV63 1379 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 MTFR1Q15390 333 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC5A1P13866 664 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PRMT2P55345 433 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 TCP10Q12799 353 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF22Q14807 665 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-216ENST00000628306 PDHXO00330 501 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 SRRDQ9UH36 339 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 H0YGN5 161 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-216ENST00000628306 OSBPP22059 807 aa29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms