RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 RBSNQ9H1K0 784 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.47■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 GPCPD1Q9NPB8 672 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF1BO60333 1816 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 ME3Q16798 604 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.46■■□□□ 1.35
PTPRJ-208ENST00000615445 COPRSQ9NQ92 184 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.45■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 ERBB3P21860 1342 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCC3O15438 1527 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT40Q6A162 431 aa23.44■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 NEBLO76041 1014 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.43■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 HS1BP3Q53T59 392 aa23.42■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 LMBRD1Q9NUN5 540 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 STAP2Q9UGK3 403 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 GOPCQ9HD26 462 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 SSH2Q76I76 1423 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.41■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 DRC1Q96MC2 740 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 STK32BQ9NY57 414 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRJ-208ENST00000615445 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.4■■□□□ 1.34
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PTPRJ-208ENST00000615445 USP17L21D6R901 530 aa23.39■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.39■■□□□ 1.33
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PTPRJ-208ENST00000615445 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC42Q96M95 316 aa23.39■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 SHROOM2Q13796 1616 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 CTNNA2P26232 953 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 MAST3O60307 1309 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 PLCD1P51178 756 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC38Q5R3I4 469 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRJ-208ENST00000615445 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.38■■□□□ 1.33
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