RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.45□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 NFICP08651 508 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 SLFN14P0C7P3 912 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 FCGRTP55899 365 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 FAAP100Q0VG06 881 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 DSC3Q14574 896 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 GATA6Q92908 595 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 BCO2Q9BYV7 579 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 CYP26A1O43174 497 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PRNPP04156 253 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ADMP35318 185 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PLCB3Q01970 1234 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 FBF1Q8TES7 1133 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.43□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 TMPRSS2O15393 492 aa6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ADAMTS4O75173 837 aa6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 KCNA1Q09470 495 aa6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PIDD1Q9HB75 910 aa6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.42□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 FAM170BA6NMN3 283 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PAX4O43316 350 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 LIG1P18858 919 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ID3Q02535 119 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PI16Q6UXB8 463 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 FBXL18Q96ME1 805 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.41□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 GSTT1P30711 240 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PDZD3Q86UT5 571 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 SHISA5Q8N114 240 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 ASB16Q96NS5 453 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.4□□□□□ -1.38
RRN3-204ENST00000561685 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.4□□□□□ -1.38
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RRN3-204ENST00000561685 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 GIPC1O14908 333 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ZNF862O60290 1169 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 NME2P22392 152 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 SULF2Q8IWU5 870 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 KCNB2Q92953 911 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.39□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ARNTP27540 789 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 MAPK8P45983 427 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ATP2B2Q01814 1243 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 C3orf58Q8NDZ4 430 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 CEP44Q9C0F1 390 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 SAMM50Q9Y512 469 aa6.38□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 AGBL5Q8NDL9 886 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.37□□□□□ -1.39
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RRN3-204ENST00000561685 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.37□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 TTLL4Q14679 1199 aa6.36□□□□□ -1.39
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RRN3-204ENST00000561685 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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RRN3-204ENST00000561685 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 SPG7Q9UQ90 795 aa6.36□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 TXKP42681 527 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 ERVK-24P63145 666 aa6.35□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RRN3-204ENST00000561685 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.35□□□□□ -1.39
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