RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SULF1Q8IWU6 871 aa29.07■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KBTBD3Q8NAB2 608 aa29.07■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PDE6AP16499 860 aa29.06■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.06■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VEZTQ9HBM0 779 aa29.06■■■□□ 2.24
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP40Q9NVE5 1235 aa29.04■■■□□ 2.24
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.02■■■□□ 2.24
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BAG3O95817 575 aa29.02■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TNFAIP1Q13829 316 aa29.02■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EVI5LQ96CN4 794 aa29.02■■■□□ 2.24
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RFX7Q2KHR2 1363 aa29■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FOCADQ5VW36 1801 aa28.99■■■□□ 2.23
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C1QTNF8P60827 252 aa28.99■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.99■■■□□ 2.23
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DLK2Q6UY11 383 aa28.98■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CERS3Q8IU89 383 aa28.98■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MIGA1Q8NAN2 632 aa28.98■■■□□ 2.23
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IDI2Q9BXS1 227 aa28.97■■■□□ 2.23
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CNTNAP1P78357 1384 aa28.97■■■□□ 2.23
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TEX11Q8IYF3 940 aa28.96■■■□□ 2.23
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.92■■■□□ 2.22
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCP10Q12799 353 aa28.91■■■□□ 2.22
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MBD4O95243 580 aa28.9■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APLP1P51693 650 aa28.9■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LCORLQ8N3X6 602 aa28.9■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AIDAQ96BJ3 306 aa28.9■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TEPSINQ96N21 525 aa28.9■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NF2P35240 595 aa28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OSBP2Q969R2 916 aa28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARMT1Q9H993 441 aa28.89■■■□□ 2.22
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SSC5DA1L4H1 1573 aa28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SDSP20132 328 aa28.88■■■□□ 2.21
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.88■■■□□ 2.21
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