RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 PPP4CP60510 307 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 GSTO1P78417 241 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 TNIP1Q15025 636 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 HHIPL2Q6UWX4 724 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 TEKT1Q969V4 418 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 AIDAQ96BJ3 306 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 ZDHHC15Q96MV8 337 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 USP26Q9BXU7 913 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 TAF6LQ9Y6J9 622 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-216ENST00000549221 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SMIM22K7EJ46 135 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 REC8O95072 547 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 LDHCP07864 332 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 USP17L8P0C7I0 530 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 EVX2Q03828 476 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CFAP100Q494V2 611 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 MICALL2Q8IY33 904 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 MAP4K1Q92918 833 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 PALD1Q9ULE6 856 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SPDYE6P0CI01 402 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CACNB3P54284 484 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 GPC2Q8N158 579 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 MRIQ9BWK5 157 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 FGAP02671 866 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 HSPA4P34932 840 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 EPS15P42566 896 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 NFIAQ12857 509 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 NECTIN1Q15223 517 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 NBPF9Q3BBW0 867 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SLF2Q8IX21 1173 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 RASEFQ8IZ41 740 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 DPF2Q92785 391 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 KIF2CQ99661 725 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 NBPF3Q9H094 633 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 USP40Q9NVE5 1235 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 FOCADQ5VW36 1801 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ECM29Q5VYK3 1845 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CLRN2A0PK11 232 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 WNT10BO00744 389 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SLC27A2O14975 620 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 BAG3O95817 575 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CYP2D6P10635 497 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 DLGAP5Q15398 846 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ALX1Q15699 326 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 TEX11Q8IYF3 940 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 OGFOD1Q8N543 542 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 FLT1P17948 1338 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-216ENST00000549221 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms