RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 AACSQ86V21 672 aa29.65■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.65■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 DCAF15Q66K64 600 aa29.64■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.64■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.64■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 PRDM10Q9NQV6 1147 aa29.64■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 USP40Q9NVE5 1235 aa29.64■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 RAI14Q9P0K7 980 aa29.64■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
PITX3-202ENST00000539804 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 PRKG1Q13976 671 aa29.63■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.63■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 FAM151AQ8WW52 585 aa29.63■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa29.63■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 AOX1Q06278 1338 aa29.63■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 PCNTO95613 3336 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 MECOMQ03112 1051 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 AAMPQ13685 434 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.62■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 FOXN1O15353 648 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 SREBF2Q12772 1141 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 MOB2Q70IA6 237 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 TEPSINQ96N21 525 aa29.61■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 BAG3O95817 575 aa29.6■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 CERS3Q8IU89 383 aa29.6■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 IDI2Q9BXS1 227 aa29.6■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 ENTPD3O75355 529 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 PLCG2P16885 1265 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 INHBEP58166 350 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 MYH2Q9UKX2 1941 aa29.59■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 CACNB3P54284 484 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP29.58■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 LRRCC1Q9C099 1032 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 CSADQ9Y600 493 aa29.58■■■□□ 2.33
PITX3-202ENST00000539804 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.57■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 NPM3O75607 178 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 BTDP43251 543 aa29.57■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 PI16Q6UXB8 463 aa29.57■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.57■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.56■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 APBB1O00213 710 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 MAP3K9P80192 1104 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.55■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 SNRKQ9NRH2 765 aa29.55■■■□□ 2.32
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PITX3-202ENST00000539804 MAP3K12Q12852 859 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 SPRYD7Q5W111 196 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 CSRNP1Q96S65 589 aa29.54■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
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PITX3-202ENST00000539804 ALDH1A1P00352 501 aa29.52■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 TM4SF4P48230 202 aa29.52■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 LBX1P52954 281 aa29.52■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 TCP10Q12799 353 aa29.52■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 DCTPP1Q9H773 170 aa29.52■■■□□ 2.32
PITX3-202ENST00000539804 RGS3P49796 1198 aa29.51■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.51■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.31
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PITX3-202ENST00000539804 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 NFIAQ12857 509 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 GPATCH3Q96I76 525 aa29.5■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 WRNIP1Q96S55 665 aa29.49■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 ZIC5Q96T25 663 aa29.49■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
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PITX3-202ENST00000539804 RNF186Q9NXI6 227 aa29.48■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 FZD1Q9UP38 647 aa29.48■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 RHBDL3P58872 404 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 TEX11Q8IYF3 940 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.47■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 VGLL4Q14135 290 aa29.46■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 ZNF384Q8TF68 577 aa29.46■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 ATP5JP18859 108 aa29.45■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 PICALMQ13492 652 aa29.45■■■□□ 2.31
PITX3-202ENST00000539804 ERO1BQ86YB8 467 aa29.45■■■□□ 2.31
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