RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527920.5

SSSCA1-205, Transcript of Sjogren syndrome/scleroderma autoantigen 1, human

TSL 3 BASIC

Gene SSSCA1, Length 806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSSCA1-205	ENST00000527920	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	ABCF2	Q9UG63	623 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	COG6	Q9Y2V7	657 aa		40.66	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	SREBF2	Q12772	1141 aa		40.65	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	TRPA1	O75762	1119 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	PDE3A	Q14432	1141 aa		40.64	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
SSSCA1-205	ENST00000527920	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	FAM151A	Q8WW52	585 aa		40.62	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	MCAM	P43121	646 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	WNK4	Q96J92	1243 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		40.61	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		40.6	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	40.6	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	USP40	Q9NVE5	1235 aa		40.6	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	INHBE	P58166	350 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	PI16	Q6UXB8	463 aa		40.59	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	MECOM	Q03112	1051 aa		40.58	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	MAP3K9	P80192	1104 aa		40.57	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		40.57	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	IDI2	Q9BXS1	227 aa		40.57	■■■■■ 4.09
SSSCA1-205	ENST00000527920	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		40.57	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	HMMR	O75330	724 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	NFIA	Q12857	509 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	DCAF15	Q66K64	600 aa		40.56	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	40.56	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	OTOF	Q9HC10	1997 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	GSTO1	P78417	241 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		40.55	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	LAMB1	P07942	1786 aa		40.54	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	IGSF3	O75054	1194 aa		40.54	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZNF384	Q8TF68	577 aa		40.54	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	40.54	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	40.54	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		40.54	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	VGLL4	Q14135	290 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	CSAD	Q9Y600	493 aa		40.53	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	ENTPD3	O75355	529 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	LDHC	P07864	332 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		40.52	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	40.51	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	ALDH1A1	P00352	501 aa		40.51	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	GJA5	P36382	358 aa		40.51	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	BTD	P43251	543 aa		40.51	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	TCP10	Q12799	353 aa		40.51	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		40.51	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	ELP3	Q9H9T3	547 aa		40.51	■■■■■ 4.08
SSSCA1-205	ENST00000527920	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		40.5	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	OPTN	Q96CV9	577 aa		40.5	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	40.5	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	RAI14	Q9P0K7	980 aa		40.5	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	WRNIP1	Q96S55	665 aa		40.49	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		40.49	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		40.49	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		40.48	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		40.48	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	RGS3	P49796	1198 aa		40.47	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	IFNL1	Q8IU54	200 aa		40.47	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	SNRK	Q9NRH2	765 aa		40.47	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	RHBDL3	P58872	404 aa		40.46	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		40.46	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		40.45	■■■■■ 4.07
SSSCA1-205	ENST00000527920	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	AACS	Q86V21	672 aa		40.44	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		40.43	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	ERO1B	Q86YB8	467 aa		40.43	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		40.43	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		40.43	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	RAB11FIP3	O75154	756 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	TBC1D8	O95759	1140 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		40.42	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	40.41	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	ZAP70	P43403	619 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		40.41	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	40.41	■■■■■ 4.06
SSSCA1-205	ENST00000527920	ABHD8	Q96I13	439 aa		40.41	■■■■■ 4.06

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