RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522635.5

TCEA1-211, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TCEA1, Length 1,432 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-211ENST00000522635 CFAP100Q494V2 611 aa28.14■■■□□ 2.1
TCEA1-211ENST00000522635 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
TCEA1-211ENST00000522635 ANO2Q9NQ90 1003 aa28.14■■■□□ 2.1
TCEA1-211ENST00000522635 MICALL2Q8IY33 904 aa28.13■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.13■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.12■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 FOXP2O15409 715 aa28.11■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.11■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 RHBDL3P58872 404 aa28.11■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 VPS53Q5VIR6 699 aa28.11■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.11■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 MTMR14Q8NCE2 650 aa28.11■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 SPDYE6P0CI01 402 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 PLCG2P16885 1265 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 GNAT2P19087 354 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 DPY19L2Q6NUT2 758 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 MYOZ2Q9NPC6 264 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 GLTPD2A6NH11 291 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 PTH1RQ03431 593 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 DLGAP5Q15398 846 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 FOCADQ5VW36 1801 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 PRKAB2O43741 272 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-211ENST00000522635 MAP4K1Q92918 833 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 WDR90Q96KV7 1748 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 GSG1L2A8MUP6 293 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 H7C1D1 291 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 EGFRP00533 1210 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 TEX11Q8IYF3 940 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 USP26Q9BXU7 913 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 USP40Q9NVE5 1235 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 EPS15P42566 896 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 ZMYM6O95789 1325 aa28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 WNT10BO00744 389 aa28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 SCN4AP35499 1836 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 APPP05067 770 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 ALX1Q15699 326 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 NBPF9Q3BBW0 867 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 GIMAP6Q6P9H5 292 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 IFNL3Q8IZI9 196 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 TRPM4Q8TD43 1214 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 FLT1P17948 1338 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 USP5P45974 858 aa28.01■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa28.01■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 NACAP1Q9BZK3 213 aa28.01■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.08
TCEA1-211ENST00000522635 LAMA4Q16363 1823 aa28.01■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 IDI2Q9BXS1 227 aa28.01■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 MYO1BO43795 1136 aa28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 FGAP02671 866 aa28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 TDO2P48775 406 aa28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 CACNB3P54284 484 aa28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 NFIAQ12857 509 aa28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 NAPBQ9H115 298 aa28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 HACL1Q9UJ83 578 aa28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 LAMB1P07942 1786 aa27.99■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 CLRN2A0PK11 232 aa27.99■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.99■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 NPM3O75607 178 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 HSPA4P34932 840 aa27.98■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 NECTIN1Q15223 517 aa27.98■■■□□ 2.07
TCEA1-211ENST00000522635 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms