RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 RASGRF1Q13972 1273 aa22.54■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 VGLL4Q14135 290 aa22.54■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.54■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 OPTNQ96CV9 577 aa22.54■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.54■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 RGS19P49795 217 aa22.53■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 FAM151AQ8WW52 585 aa22.53■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 CSADQ9Y600 493 aa22.53■■□□□ 1.2
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TM2D1-211ENST00000496465 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 POLA2Q14181 598 aa22.51■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.51■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.51■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 PTPN18Q99952 460 aa22.51■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ATP8B2P98198 1209 aa22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 DCAF15Q66K64 600 aa22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 SSH3Q8TE77 659 aa22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 USP40Q9NVE5 1235 aa22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 GAKO14976 1311 aa22.5■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 RLBP1P12271 317 aa22.49■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 NFIAQ12857 509 aa22.49■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 WRNIP1Q96S55 665 aa22.49■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.49■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ABCF2Q9UG63 623 aa22.49■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.49■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 DOCK2Q92608 1830 aa22.49■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.48■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 GTF2A2P52657 109 aa22.48■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 SLF2Q8IX21 1173 aa22.48■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.48■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 TCP10Q12799 353 aa22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 GORABQ5T7V8 394 aa22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ERO1BQ86YB8 467 aa22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 OTUD5Q96G74 571 aa22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 IDI2Q9BXS1 227 aa22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 GPR108Q9NPR9 543 aa22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.47■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 CRHR2Q13324 411 aa22.46■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.46■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 SPATA5Q8NB90 893 aa22.46■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.46■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.46■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.46■■□□□ 1.19
TM2D1-211ENST00000496465 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.45■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.45■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 ENTPD3O75355 529 aa22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 MECOMQ03112 1051 aa22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 CCL15Q16663 113 aa22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF384Q8TF68 577 aa22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.43■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 RGS3P49796 1198 aa22.43■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 PPIL2Q13356 520 aa22.43■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 TNNI3KQ59H18 835 aa22.43■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 PI16Q6UXB8 463 aa22.43■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.43■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 IRF6O14896 467 aa22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 CETPP11597 493 aa22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 INPP5BP32019 993 aa22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 MCAMP43121 646 aa22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 BTDP43251 543 aa22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 PPATQ06203 517 aa22.42■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 HTTP42858 3142 aa22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 SNAPC2Q13487 334 aa22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 ERO1AQ96HE7 468 aa22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 LDHCP07864 332 aa22.4■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 RHBDL3P58872 404 aa22.4■■□□□ 1.18
TM2D1-211ENST00000496465 GSTO1P78417 241 aa22.4■■□□□ 1.18
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