RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC27A2	O14975	620 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NTSR2	O95665	410 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP5J	P18859	108 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	MCC	P23508	829 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	NUCB2	P80303	420 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	MCTP1	Q6DN14	999 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	GPT2	Q8TD30	523 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP4K1	Q92918	833 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	PIM2	Q9P1W9	311 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	BCS1L	Q9Y276	419 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	AXIN1	O15169	862 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TAF5L	O75529	589 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	SRGN	P10124	158 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	ADORA1	P30542	326 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	APLP1	P51693	650 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	TIMM10	P62072	90 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	GBP4	Q96PP9	640 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		6.97	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		6.96	□□□□□ -1.29
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH3	P11055	1940 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	EYA2	O00167	538 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ALDH1B1	P30837	517 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MCM2	P49736	904 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNMA1	Q12791	1236 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TTLL6	Q8N841	843 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CNKSR1	Q969H4	720 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MASTL	Q96GX5	879 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	HAUS7	Q99871	368 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	FSD1	Q9BTV5	496 aa		6.96	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	C21orf2	O43822	256 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CSF1R	P07333	972 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	NPR1	P16066	1061 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CAMK2B	Q13554	666 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SCARF1	Q14162	830 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	E2F4	Q16254	413 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ME3	Q16798	604 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	STYK1	Q6J9G0	422 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	NECAB1	Q8N987	351 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GPATCH3	Q96I76	525 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	C4A	P0C0L4	1744 aa		6.95	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MYH7	P12883	1935 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXP2	O15409	715 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GRIN3B	O60391	1043 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PDE8A	O60658	829 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CIAO1	O76071	339 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	GSK3A	P49840	483 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP3K9	P80192	1104 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	VPS53	Q5VIR6	699 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	PACS2	Q86VP3	889 aa		6.94	□□□□□ -1.3
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		6.94	□□□□□ -1.3

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