RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 BRF1Q92994 677 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 GPT2Q8TD30 523 aa20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD1Q15327 319 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 TMC4Q7Z404 712 aa20.41■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 OFD1O75665 1012 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 TDO2P48775 406 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.4■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PRRT4-205ENST00000489835 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 IL1R1P14778 569 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 GNAT2P19087 354 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 APOBRQ0VD83 1088 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 ALX1Q15699 326 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 HS1BP3Q53T59 392 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.39■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 SMIM22K7EJ46 135 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 DOK7Q18PE1 504 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 NCOA7Q8NI08 942 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 PDLIM2Q96JY6 352 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 SMC3Q9UQE7 1217 aa20.38■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 B4E1Z4 1266 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 FBXW7Q969H0 707 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 SLX4Q8IY92 1834 aa20.37■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 LTBP1Q14766 1721 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 PRC1O43663 620 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 ANTXR2P58335 489 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 STYK1Q6J9G0 422 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 NEDD4P46934 1319 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB7AO95365 584 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 GJB2P29033 226 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 GTF2IP78347 998 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 TRDNQ13061 729 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.36■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 CHD4Q14839 1912 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 MCM5P33992 734 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.35■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 MBD3O95983 291 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 TOMM22Q9NS69 142 aa20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 EVX2Q03828 476 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 ZMYM6O95789 1325 aa20.33■□□□□ 0.85
PRRT4-205ENST00000489835 SYCE3A1L190 88 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 ZBTB22O15209 634 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 CNKSR1Q969H4 720 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 MXD3Q9BW11 206 aa20.33■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 G3V3G9 751 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 PPFIA3O75145 1194 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 BRD1O95696 1058 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 PPARAQ07869 468 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 SCRN1Q12765 414 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 COA1Q9GZY4 146 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.32■□□□□ 0.84
PRRT4-205ENST00000489835 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms