RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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RABGGTB-209ENST00000473406 CBX8Q9HC52 389 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 MARK1Q9P0L2 795 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
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RABGGTB-209ENST00000473406 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.23□□□□□ -1.09
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RABGGTB-209ENST00000473406 GHRHP01286 108 aa8.21□□□□□ -1.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 SGSM3Q96HU1 749 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 STAT3P40763 770 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
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RABGGTB-209ENST00000473406 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 NCAPHQ15003 741 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 VHLLQ6RSH7 139 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-209ENST00000473406 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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