RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 TBX22Q9Y458 520 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM37O94972 964 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 MCM4P33991 863 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB33AQ14088 237 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 PDZD3Q86UT5 571 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 WNT8BQ93098 351 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 IMPDH2P12268 514 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 GIPRP48546 466 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 PIP4K2BP78356 416 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 GRIK5Q16478 980 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 KANK3Q6NY19 840 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDT8Q8WV74 236 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-207ENST00000470201 IGF1RP08069 1367 aa6.9□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 SDE2Q6IQ49 451 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 PPME1Q9Y570 386 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 ALBP02768 609 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 CYP11A1P05108 521 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 EPXP11678 715 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL4DP49703 201 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT76Q01546 638 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 GSTM4Q03013 218 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 GK5Q6ZS86 529 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 CRBNQ96SW2 442 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 BAG6P46379 1132 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM169BQ8N8A8 192 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNB2Q92953 911 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 CORO1BQ9BR76 489 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 KRT82Q9NSB4 513 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 LILRB5O75023 590 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 ATE1O95260 518 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 CDC25BP30305 580 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 CLCQ05315 142 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 RASA3Q14644 834 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 HGSNATQ68CP4 663 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 SNTG2Q9NY99 539 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC01387J3KSC0 135 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 FSCN2O14926 492 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 POU4F3Q15319 338 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 GPBAR1Q8TDU6 330 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD62A6NC57 917 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 M0R082 166 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 SELPP16109 830 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 DDR2Q16832 855 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 MSL1Q68DK7 614 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-207ENST00000470201 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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