RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AIDAQ96BJ3 306 aa16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WNT10BO00744 389 aa16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
TTC28-AS1-204ENST00000424161 M0R2C6 588 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SGSM2O43147 1006 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GPAA1O43292 621 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYO1BO43795 1136 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MBD4O95243 580 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EPHX2P34913 555 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RHBDL3P58872 404 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC171Q6TFL3 1326 aa16.14■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POTECB2RU33 542 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EGFRP00533 1210 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GNAT2P19087 354 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LCORLQ8N3X6 602 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARMT1Q9H993 441 aa16.13■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPDYE2Q495Y8 402 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TEX11Q8IYF3 940 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP40Q9NVE5 1235 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 C8orf34Q49A92 452 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FKBP1CQ5VVH2 108 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IDI2Q9BXS1 227 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 IL25Q9H293 177 aa16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RRAGCQ9HB90 399 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FOCADQ5VW36 1801 aa16.1■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CLRN2A0PK11 232 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.09■□□□□ 0.17
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 REC8O95072 547 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP5P45974 858 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TNFAIP1Q13829 316 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DDRGK1Q96HY6 314 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GGA3Q9NZ52 723 aa16.08■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FOXP2O15409 715 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRKAB2O43741 272 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ENTPD3O75355 529 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TNNI2P48788 182 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CACNB3P54284 484 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NFIAQ12857 509 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ALX1Q15699 326 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 VPS53Q5VIR6 699 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM83AQ86UY5 434 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 VEZTQ9HBM0 779 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.07■□□□□ 0.16
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZMYM6O95789 1325 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms