RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 DISP2A7MBM2 1401 aa21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 CPLX1O14810 134 aa21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ANTXR2P58335 489 aa21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP1A3P13637 1013 aa21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 FANCCQ00597 558 aa21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CAPN2P17655 700 aa21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 ADORA1P30542 326 aa21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 PIP4K2BP78356 416 aa21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 ANO1Q5XXA6 986 aa21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 BRAPQ7Z569 592 aa21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 MNS1Q8NEH6 495 aa21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 TADA3O75528 432 aa21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 TICAM2Q86XR7 235 aa21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX35Q5T0J7 233 aa21.13■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 ATG3Q9NT62 314 aa21.13■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 TJP1Q07157 1748 aa21.13■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 FANCGO15287 622 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 SCARF1Q14162 830 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 AIFM3Q96NN9 605 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CMA1P23946 247 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC20A2Q08357 652 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 PI16Q6UXB8 463 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 EFCAB8A8MWE9 144 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 IKBKBO14920 756 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CARD6Q9BX69 1037 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 TMX1Q9H3N1 280 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP8B1O43520 1251 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 TPM1P09493 284 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 NCOA7Q8NI08 942 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 SPEF2Q9C093 1822 aa21.11■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CIAO1O76071 339 aa21.1■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.1■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 XAGE2Q96GT9 111 aa21.1■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.1■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 VGLL3A8MV65 326 aa21.1■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPN21Q16825 1174 aa21.1■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 DPF2Q92785 391 aa21.1■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 EXOC5O00471 708 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 ZAP70P43403 619 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC39A14Q15043 492 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 NKX2-3Q8TAU0 364 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGB4P16144 1822 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 RXRAP19793 462 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 SYKP43405 635 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 PHLPP1O60346 1717 aa21.09■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF213O14771 459 aa21.08■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 UBASH3AP57075 661 aa21.08■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.08■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 NEK11Q8NG66 645 aa21.08■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.08■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.08■□□□□ 0.97
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.08■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.08■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 PNOCQ13519 176 aa21.08■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 APPBP2Q92624 585 aa21.08■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 GPAA1O43292 621 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 CBFA2T2O43439 604 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 SASH3O75995 380 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D8O95759 1140 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 SHC4Q6S5L8 630 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS37DQ86XT2 251 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 TXLNBQ8N3L3 684 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINC1P01008 464 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.07■□□□□ 0.96
RALGPS1-208ENST00000424082 NBPF3Q9H094 633 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms