RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421827.2

UBXN11-208, Transcript of UBX domain protein 11, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN11, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11-208ENST00000421827 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 PI16Q6UXB8 463 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 SLF2Q8IX21 1173 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 USP40Q9NVE5 1235 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.21■■□□□ 1.15
UBXN11-208ENST00000421827 MCAMP43121 646 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 TM4SF4P48230 202 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 SREBF2Q12772 1141 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 GAKO14976 1311 aa22.2■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 PDE3AQ14432 1141 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 FAM151AQ8WW52 585 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 HOOK2Q96ED9 719 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 WNK4Q96J92 1243 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 MECOMQ03112 1051 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 NFIAQ12857 509 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 MAP3K9P80192 1104 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 TCP10Q12799 353 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 ELP3Q9H9T3 547 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 DCAF15Q66K64 600 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 RAI14Q9P0K7 980 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 HMMRO75330 724 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 BTDP43251 543 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 INHBEP58166 350 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 GSTO1P78417 241 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF384Q8TF68 577 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 SNRKQ9NRH2 765 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 CSADQ9Y600 493 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 OTOFQ9HC10 1997 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-208ENST00000421827 LDHCP07864 332 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 GJA5P36382 358 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 VGLL4Q14135 290 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 IDI2Q9BXS1 227 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 CAPN15O75808 1086 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 RGS3P49796 1198 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 OPTNQ96CV9 577 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 WRNIP1Q96S55 665 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 ENTPD3O75355 529 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 TBC1D8O95759 1140 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 ALDH1A1P00352 501 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 AACSQ86V21 672 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 IFNL1Q8IU54 200 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 ZAP70P43403 619 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 RHBDL3P58872 404 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.1■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 APBB1O00213 710 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 AK9Q5TCS8 1911 aa22.09■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 IGSF3O75054 1194 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 RAB11FIP3O75154 756 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 PICALMQ13492 652 aa22.08■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
UBXN11-208ENST00000421827 ERO1BQ86YB8 467 aa22.08■■□□□ 1.13
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