RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.33■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 GAKO14976 1311 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 MCAMP43121 646 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 PI16Q6UXB8 463 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 DBNDD2Q9BQY9 259 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 TM4SF4P48230 202 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 SLF2Q8IX21 1173 aa25.31■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 OTOFQ9HC10 1997 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 TRPA1O75762 1119 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM151AQ8WW52 585 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 USP40Q9NVE5 1235 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 MECOMQ03112 1051 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 SREBF2Q12772 1141 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 NFIAQ12857 509 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF384Q8TF68 577 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 HOOK2Q96ED9 719 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 WNK4Q96J92 1243 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 LAMB1P07942 1786 aa25.28■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 HMMRO75330 724 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.27■■□□□ 1.64
UBE2E3-201ENST00000392415 AK9Q5TCS8 1911 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K9P80192 1104 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 IDI2Q9BXS1 227 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 INHBEP58166 350 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 TCP10Q12799 353 aa25.25■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 LDHCP07864 332 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 BTDP43251 543 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 GSTO1P78417 241 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 SNRKQ9NRH2 765 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 RAI14Q9P0K7 980 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.24■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 GJA5P36382 358 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 VGLL4Q14135 290 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 DCAF15Q66K64 600 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 ELP3Q9H9T3 547 aa25.23■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 ENTPD3O75355 529 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 CSADQ9Y600 493 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 RGS3P49796 1198 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 RHBDL3P58872 404 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 AACSQ86V21 672 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 OPTNQ96CV9 577 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 WRNIP1Q96S55 665 aa25.21■■□□□ 1.63
UBE2E3-201ENST00000392415 IGSF3O75054 1194 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ZAP70P43403 619 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 RAB11FIP3O75154 756 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D8O95759 1140 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ALDH1A1P00352 501 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 IFNL1Q8IU54 200 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF112Q9UJU3 913 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 MAST2Q6P0Q8 1798 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E3-201ENST00000392415 DOCK2Q92608 1830 aa25.18■■□□□ 1.62
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