RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382940.8

NME4-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NME4, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-202ENST00000382940 GPR108Q9NPR9 543 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 USP40Q9NVE5 1235 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa26.74■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 TM4SF4P48230 202 aa26.73■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.73■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.73■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.73■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.73■■□□□ 1.87
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NME4-202ENST00000382940 CSADQ9Y600 493 aa26.73■■□□□ 1.87
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NME4-202ENST00000382940 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
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NME4-202ENST00000382940 MAP3K9P80192 1104 aa26.71■■□□□ 1.87
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NME4-202ENST00000382940 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
NME4-202ENST00000382940 PI16Q6UXB8 463 aa26.7■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 RAI14Q9P0K7 980 aa26.7■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 GSTO1P78417 241 aa26.69■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 ERC1Q8IUD2 1116 aa26.69■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.69■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 GAKO14976 1311 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 TBC1D8O95759 1140 aa26.68■■□□□ 1.86
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NME4-202ENST00000382940 MECOMQ03112 1051 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 NFIAQ12857 509 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 VGLL4Q14135 290 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.863e-13■■■□□ 17.3
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NME4-202ENST00000382940 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.68■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.67■■□□□ 1.86
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NME4-202ENST00000382940 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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NME4-202ENST00000382940 LDHCP07864 332 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.66■■□□□ 1.86
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NME4-202ENST00000382940 IFNL1Q8IU54 200 aa26.65■■□□□ 1.86
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NME4-202ENST00000382940 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.64■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.64■■□□□ 1.86
NME4-202ENST00000382940 RGS3P49796 1198 aa26.63■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 PICALMQ13492 652 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-202ENST00000382940 PDE3AQ14432 1141 aa26.62■■□□□ 1.85
NME4-202ENST00000382940 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.61■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.61■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 GPR25O00155 361 aa26.6■■□□□ 1.85
NME4-202ENST00000382940 APBB1O00213 710 aa26.6■■□□□ 1.85
NME4-202ENST00000382940 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.855e-7■■■■■ 32
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NME4-202ENST00000382940 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.59■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.58■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.58■■□□□ 1.85
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NME4-202ENST00000382940 BCL11AQ9H165 835 aa26.58■■□□□ 1.85
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