RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 SPDYE6P0CI01 402 aa35.57■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa35.57■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 HELLSQ9NRZ9 838 aa35.57■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa35.56■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 M0R2C6 588 aa35.56■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 BAG3O95817 575 aa35.56■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 IQCA1LA6NCM1 817 aa35.55■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 TRPM4Q8TD43 1214 aa35.55■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
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ECHS1-201ENST00000368547 AIDAQ96BJ3 306 aa35.54■■■■□ 3.28
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ECHS1-201ENST00000368547 ECM29Q5VYK3 1845 aa35.54■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 MBD4O95243 580 aa35.54■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 PPP4CP60510 307 aa35.54■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 NBPF9Q3BBW0 867 aa35.54■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa35.54■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 CASC1Q6TDU7 716 aa35.54■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 EPHX2P34913 555 aa35.53■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 LCORLQ8N3X6 602 aa35.53■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 RUFY2Q8WXA3 655 aa35.53■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 ARMT1Q9H993 441 aa35.53■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa35.52■■■■□ 3.28
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ECHS1-201ENST00000368547 IL25Q9H293 177 aa35.51■■■■□ 3.28
ECHS1-201ENST00000368547 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
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ECHS1-201ENST00000368547 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
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ECHS1-201ENST00000368547 USP40Q9NVE5 1235 aa35.5■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa35.5■■■■□ 3.27
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ECHS1-201ENST00000368547 CERS3Q8IU89 383 aa35.5■■■■□ 3.27
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ECHS1-201ENST00000368547 NMRK2Q9NPI5 230 aa35.48■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 RAD50Q92878 1312 aa35.48■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 CLRN2A0PK11 232 aa35.46■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 SGSM2O43147 1006 aa35.46■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC171Q6TFL3 1326 aa35.46■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 SPDYE2Q495Y8 402 aa35.46■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 TEX11Q8IYF3 940 aa35.46■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
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ECHS1-201ENST00000368547 CACNB3P54284 484 aa35.45■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
ECHS1-201ENST00000368547 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa35.43■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 TMOD2Q9NZR1 351 aa35.43■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 SEC24BO95487 1268 aa35.42■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa35.42■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 SDR42E1Q8WUS8 393 aa35.42■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 VEZTQ9HBM0 779 aa35.42■■■■□ 3.26
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ECHS1-201ENST00000368547 VPS53Q5VIR6 699 aa35.41■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 YY1P25490 414 aa35.4■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 NFIAQ12857 509 aa35.4■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 GGA3Q9NZ52 723 aa35.4■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 USP5P45974 858 aa35.39■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 IDI2Q9BXS1 227 aa35.39■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
ECHS1-201ENST00000368547 PICALMQ13492 652 aa35.39■■■■□ 3.26
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ECHS1-201ENST00000368547 NAV1Q8NEY1 1877 aa35.37■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 GSG1L2A8MUP6 293 aa35.37■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
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ECHS1-201ENST00000368547 APPP05067 770 aa35.37■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 FAM198AQ9UFP1 575 aa35.37■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 FLT1P17948 1338 aa35.36■■■■□ 3.25
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ECHS1-201ENST00000368547 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa35.36■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 POTEIP0CG38 1075 aa35.35■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 POTEJP0CG39 1038 aa35.35■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 TCP10Q12799 353 aa35.35■■■■□ 3.25
ECHS1-201ENST00000368547 FKBP1CQ5VVH2 108 aa35.35■■■■□ 3.25
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