RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 FZD9O00144 591 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 RASEFQ8IZ41 740 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 GAKO14976 1311 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 FGAP02671 866 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 TEKT1Q969V4 418 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXA4-201ENST00000360046 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.08■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 TDO2P48775 406 aa26.08■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.08■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.08■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 NAPBQ9H115 298 aa26.08■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 SBF1O95248 1867 aa26.08■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 CYP21A2P08686 494 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 PPP4CP60510 307 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 CERS3Q8IU89 383 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 KCNB2Q92953 911 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 CRKP46108 304 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 RABEP1Q15276 862 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 PLCG2P16885 1265 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 ALX1Q15699 326 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 ZMYM6O95789 1325 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 LAMA4Q16363 1823 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 HAND2P61296 217 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF213O14771 459 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 USP5P45974 858 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 TEX11Q8IYF3 940 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 OGFOD1Q8N543 542 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 IL17RAQ96F46 866 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 GMLQ99445 158 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 MRIQ9BWK5 157 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 USP17L8P0C7I0 530 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 KRT32Q14532 448 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-201ENST00000360046 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 RHBDL3P58872 404 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 NEK4P51957 841 aa26■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 CFAP100Q494V2 611 aa26■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 USP40Q9NVE5 1235 aa26■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 ECM29Q5VYK3 1845 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 FOCADQ5VW36 1801 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 PSMA5P28066 241 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 E7EWF7 191 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 TM6SF1Q9BZW5 370 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 LAMB1P07942 1786 aa25.98■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 GPC2Q8N158 579 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 ST18O60284 1047 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 CPA1P15085 419 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 NBPF3Q9H094 633 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 SHTN1A0MZ66 631 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 USP17L12C9JPN9 530 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 USP17L21D6R901 530 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 PPARAQ07869 468 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 CTR9Q6PD62 1173 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXA4-201ENST00000360046 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms