RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 GYG1P46976 350 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 BCAMP50895 628 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CCDC102BQ68D86 513 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 VPS37DQ86XT2 251 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 BORCS6Q96GS4 357 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 G3V3G9 751 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PODNQ7Z5L7 613 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CD209Q9NNX6 404 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 MTMR7Q9Y216 660 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 IL1R1P14778 569 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 MCM5P33992 734 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PRELPP51888 382 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 JDP2Q8WYK2 163 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CAPN2P17655 700 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SCP2P22307 547 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PHKA1P46020 1223 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 DOK7Q18PE1 504 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 NIM1KQ8IY84 436 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GPATCH3Q96I76 525 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ARAP2Q8WZ64 1704 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SEMA3EO15041 775 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ECHDC1Q9NTX5 307 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 STAP2Q9UGK3 403 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SBF1O95248 1867 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ECE2O60344 883 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 MX1P20591 662 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 NME8Q8N427 588 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 UTRNP46939 3433 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ATP5JP18859 108 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PDE1AP54750 535 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 BECN1Q14457 450 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 FZD9O00144 591 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ERC2O15083 957 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 C9orf131Q5VYM1 1079 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 RNF181Q9P0P0 153 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 YDJCA8MPS7 323 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CD151P48509 253 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 RASGRF1Q13972 1273 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 AOX1Q06278 1338 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CHD4Q14839 1912 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 COL4A5P29400 1685 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CCDC189A1A4V9 331 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 MCAMP43121 646 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SPATA5Q8NB90 893 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 MTA3Q9BTC8 594 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 USP17L3A6NCW0 530 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 USP17L4A6NCW7 530 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 GTF2IP78347 998 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-201ENST00000351328 SCARF1Q14162 830 aa8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms