RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 ERICH4A6NGS2 130 aa23.04■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 CBX1P83916 185 aa23.04■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 USP44Q9H0E7 712 aa23.04■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.04■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 RIMBP2O15034 1052 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 POLD1P28340 1107 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 KIF5AQ12840 1032 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 SPATA5Q8NB90 893 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 SHROOM2Q13796 1616 aa23.03■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 IFNKQ9P0W0 207 aa23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 NBPF14Q5TI25 921 aa23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 CNGA4Q8IV77 575 aa23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC42Q96M95 316 aa23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 CTAGE9A4FU28 777 aa23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 CUTAO60888 179 aa23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LRIG1-201ENST00000273261 NEK11Q8NG66 645 aa23.02■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.01■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 UBXN1Q04323 297 aa23.01■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 A0A1B0GVL5 298 aa23.01■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 SLU7O95391 586 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 NF2P35240 595 aa23.01■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 SV2BQ7L1I2 683 aa23.01■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.01■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 NLRP1Q9C000 1473 aa23■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC65Q8IXS2 484 aa23■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 VWA3AA6NCI4 1184 aa23■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 ACTN2P35609 894 aa23■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 STK24Q9Y6E0 443 aa22.99■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 PHACTR2O75167 634 aa22.99■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 BEND3Q5T5X7 828 aa22.99■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.99■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF174Q15697 407 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 METP08581 1390 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 ZAP70P43403 619 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 STX17P56962 302 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 KDM6BO15054 1643 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 HSF2BPO75031 334 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM14Q14142 442 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.98■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 TUBBP07437 444 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 CTSWP56202 376 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 LETM2Q2VYF4 491 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 PTGS1P23219 599 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 KIF1BO60333 1816 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 FSD2A1L4K1 749 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 JAG2Q9Y219 1238 aa22.97■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF445P59923 1031 aa22.96■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.96■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA1Q92805 767 aa22.96■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LRIG1-201ENST00000273261 HAUS3Q68CZ6 603 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 KRT222Q8N1A0 295 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 TAF5LO75529 589 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 MLKLQ8NB16 471 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 E7EWF7 191 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 INCENPQ9NQS7 918 aa22.95■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 TTC38Q5R3I4 469 aa22.94■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.94■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 SYNCQ9H7C4 482 aa22.94■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 STK32BQ9NY57 414 aa22.94■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 USP6P35125 1406 aa22.94■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LRIG1-201ENST00000273261 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms