RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264938.7

SLC9A3-201, Transcript of solute carrier family 9 member A3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC9A3, Length 2,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-201ENST00000264938 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 OLFM4Q6UX06 510 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 A0A0U1RQJ8 604 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 FBXL16Q8N461 479 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 ATRIPQ8WXE1 791 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 SUGCTQ9HAC7 445 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 NOP2P46087 812 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 FOXR1Q6PIV2 292 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 CPLX1O14810 134 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 BRD3Q15059 726 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 IQUBQ8NA54 791 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 PRC1O43663 620 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 CHMP4BP1P59074 171 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 PTPAQ15257 358 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 OSBP2Q969R2 916 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 PNKPQ96T60 521 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 FOXP2O15409 715 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 USP54Q70EL1 1684 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 CUTAO60888 179 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC9A3-201ENST00000264938 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ANTXR2P58335 489 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.64■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 EFCC1Q9HA90 598 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 LZTFL1Q9NQ48 299 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 RESP18Q5W5W9 173 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 VPS37DQ86XT2 251 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 SOWAHDA6NJG2 315 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 SPECC1Q5M775 1068 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 CNNM3Q8NE01 707 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 A0A087WZG4 1122 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 PPP6R2O75170 966 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 MAP3K14Q99558 947 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 FAN1Q9Y2M0 1017 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 MYO1BO43795 1136 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC102BQ68D86 513 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ABCB6Q9NP58 842 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 NFAT5O94916 1531 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF18P17022 549 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF827Q17R98 1081 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ZNF790Q6PG37 636 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 KCNH3Q9ULD8 1083 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 HDXQ7Z353 690 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 MED15Q96RN5 788 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 L1RE1Q9UN81 338 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 FGAP02671 866 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ALG1Q9BT22 464 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 RAB21Q9UL25 225 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 TBX22Q9Y458 520 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 RXRAP19793 462 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 MAN1B1Q9UKM7 699 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 EID1Q9Y6B2 187 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 USP5P45974 858 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 KRT40Q6A162 431 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 RAD9BQ6WBX8 426 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 C5P01031 1676 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-201ENST00000264938 CCDC175P0C221 793 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC9A3-201ENST00000264938 CASP7P55210 303 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC9A3-201ENST00000264938 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC9A3-201ENST00000264938 CDC23Q9UJX2 597 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC9A3-201ENST00000264938 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SLC9A3-201ENST00000264938 JMYQ8N9B5 988 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC9A3-201ENST00000264938 PRR29P0C7W0 189 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC9A3-201ENST00000264938 MSANTD4Q8NCY6 345 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC9A3-201ENST00000264938 RAI14Q9P0K7 980 aa26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms