RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259750.8

TTBK1-201, Transcript of tau tubulin kinase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTBK1, Length 6,932 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC169A6NNP5 214 aa17.83■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CPLX4Q7Z7G2 160 aa17.83■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TSGA10Q9BZW7 698 aa17.83■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 PTPDC1A2A3K4 754 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 LETM2Q2VYF4 491 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 SV2BQ7L1I2 683 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 GTF3C6Q969F1 213 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 VWA3AA6NCI4 1184 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CALCOCO2Q13137 446 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 IFNKQ9P0W0 207 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 INF2Q27J81 1249 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 KIFAP3Q92845 792 aa17.82■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CREB3L3Q68CJ9 461 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 FAM204AQ9H8W3 233 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 NPHP3Q7Z494 1330 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 EIF6P56537 245 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 IL2RBP14784 551 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TNNC1P63316 161 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 PICK1Q9NRD5 415 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 SAMD15Q9P1V8 674 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 STX10O60499 249 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 DAPK3O43293 454 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 RPL13P26373 211 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 SETDB1Q15047 1291 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 JAKMIP2Q96AA8 810 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.81■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 GABPAQ06546 454 aa17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CEP57Q86XR8 500 aa17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CEP85Q6P2H3 762 aa17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TSPOAP1O95153 1857 aa17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 SLC8A3P57103 927 aa17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 BTG4Q9NY30 223 aa17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 FCHSD1Q86WN1 690 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 C10orf67Q8IYJ2 551 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TRAF5O00463 557 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 SPOPO43791 374 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TUBB4AP04350 444 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 SH2D4AQ9H788 454 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 MBD4O95243 580 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 DCTPP1Q9H773 170 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 KDM2BQ8NHM5 1336 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TNFAIP3P21580 790 aa17.79■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CIB2O75838 187 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TRPC3Q13507 836 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 RUFY3Q7L099 469 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 STRN3Q13033 797 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TEX11Q8IYF3 940 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 STK32BQ9NY57 414 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 MAEAQ7L5Y9 396 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 RIMS2Q9UQ26 1411 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 GNPATO15228 680 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 VAV2P52735 878 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 NBPF11Q86T75 865 aa17.78■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 SMTNP53814 917 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 PPP2R5DQ14738 602 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 IQUBQ8NA54 791 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 GINS2Q9Y248 185 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 TTC41PQ6P2S7 1318 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 CCDC122Q5T0U0 273 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 VPS52Q8N1B4 723 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 UFL1O94874 794 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 KRBA2Q6ZNG9 492 aa17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TTBK1-201ENST00000259750 HSPA1LP34931 641 aa17.77■□□□□ 0.43
TTBK1-201ENST00000259750 BRAPQ7Z569 592 aa17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms