RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 EVX2Q03828 476 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.25■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 CACNB3P54284 484 aa22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 GSTO1P78417 241 aa22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 TNIP1Q15025 636 aa22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 MAP4K1Q92918 833 aa22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 GRIN3BO60391 1043 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 CFAP100Q494V2 611 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 TEKT1Q969V4 418 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 GAKO14976 1311 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.23■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 FGAP02671 866 aa22.22■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 LDHCP07864 332 aa22.22■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 USP17L8P0C7I0 530 aa22.22■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 RHBDL3P58872 404 aa22.22■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 RASEFQ8IZ41 740 aa22.22■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 HAND2P61296 217 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 TICAM2Q86XR7 235 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 MICALL2Q8IY33 904 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 USP40Q9NVE5 1235 aa22.21■■□□□ 1.15
PRRT1-201ENST00000211413 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.2■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.2■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.2■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 NECTIN1Q15223 517 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 INCENPQ9NQS7 918 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CLRN2A0PK11 232 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 BAG3O95817 575 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 EPS15P42566 896 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 PPP4CP60510 307 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 PICALMQ13492 652 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 TEX11Q8IYF3 940 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 OGFOD1Q8N543 542 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 NFIAQ12857 509 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 SLF2Q8IX21 1173 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 SLC27A2O14975 620 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CYP2D6P10635 497 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 HSPA4P34932 840 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 USP5P45974 858 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 KIF2CQ99661 725 aa22.18■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CYP21A2P08686 494 aa22.17■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 SLURP2P0DP57 97 aa22.17■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 ZFPM1Q8IX07 1006 aa22.17■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 GPC2Q8N158 579 aa22.17■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.17■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.17■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 TDO2P48775 406 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 TCP10Q12799 353 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 DLGAP5Q15398 846 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 SPDYE6P0CI01 402 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CPA1P15085 419 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 NAPBQ9H115 298 aa22.16■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.15■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.15■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 MRIQ9BWK5 157 aa22.15■■□□□ 1.14
PRRT1-201ENST00000211413 NBPF3Q9H094 633 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms