RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028347.12

Rbms1-201, Transcript of RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rbms1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Tnni2P13412 182 aa13.74□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Atp9bP98195 1146 aa13.74□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Sgip1Q8VD37 806 aa13.74□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Dnajc10Q9DC23 793 aa13.74□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Zmym3Q9JLM4 1370 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pfkfb2P70265 519 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Phactr1Q2M3X8 580 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ppp2r5cQ60996 524 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Phc3Q8CHP6 981 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pms1Q8K119 917 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Bag3Q9JLV1 577 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Tulp4Q9JIL5 1547 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Art2aP17981 287 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gzf1Q4VBD9 706 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Map3k2Q61083 619 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 AidaQ8C4Q6 305 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Mtfr2Q8VED8 361 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ppp4r3bQ922R5 820 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Rfc4Q99J62 364 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 IydQ9DCX8 285 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Caprin2Q05A80 1031 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 N6amt1Q6SKR2 214 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Jade1Q6ZPI0 834 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Riok1Q922Q2 567 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Camk2gQ923T9 529 aa13.73□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 FxnO35943 207 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 KaznQ69ZS8 779 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ankle2Q6P1H6 964 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Wdr35Q8BND3 1181 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Npm3Q9CPP0 175 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Bin1O08539 588 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ncbp1Q3UYV9 790 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Prkg2Q61410 762 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Kdm4bQ91VY5 1086 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 NxnP97346 435 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Necab1Q8BG18 352 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 TtpalQ9D3D0 343 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Zap70P43404 618 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ifit1bl2Q3U687 466 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ptch1Q61115 1434 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 TpppQ7TQD2 218 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Snx5Q9D8U8 404 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Xpo7Q9EPK7 1087 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Irx5Q9JKQ4 484 aa13.72□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Abcc3B2RX12 1523 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 AU022751B1B0V2 589 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ankrd44B2RXR6 993 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Rasa3Q60790 834 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Nup133Q8R0G9 1155 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Nr1h3Q9Z0Y9 445 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Cpsf2O35218 782 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Best1O88870 551 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Trim63Q38HM4 350 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 ReltQ8BX43 436 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Agap3Q8VHH5 910 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Asb16Q8VHS5 453 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Atp11cQ9QZW0 1129 aa13.71□□□□□ -0.21
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Nphp4P59240 1425 aa13.71□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 GptQ8QZR5 496 aa13.71□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Echdc1Q9D9V3 322 aa13.71□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Zscan20B2KFW1 1030 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Eif4a2P10630 407 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Fam83gQ5SWY7 812 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Elf1Q60775 612 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Anks6Q6GQX6 883 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Lmod1Q8BVA4 595 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 SowahdQ8BY98 327 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Wdr60Q8C761 999 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pde6cQ91ZQ1 861 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Bcar3Q9QZK2 820 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gm6133B2RY53 190 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Heatr4E9Q357 955 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Stag2O35638 1231 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 ChkbO55229 394 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Alox12eP55249 662 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Etaa1Q5SVT3 877 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Pof1bQ8K4L4 587 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Jakmip3Q5DTN8 844 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Krt72Q6IME9 520 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Bbs9Q811G0 885 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Krt85Q9Z2T6 507 aa13.7□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gnat3Q3V3I2 354 aa13.69□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 SargQ8BI29 606 aa13.69□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Lrrfip2Q91WK0 415 aa13.69□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Cep170Q6A065 1588 aa13.69□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Gli2Q0VGT2 1544 aa13.69□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Ttll6A4Q9E8 822 aa13.69□□□□□ -0.22
Rbms1-201ENSMUST00000028347 Krt13P08730 437 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.6 ms