Protein–RNA interactions for Protein: P55249

Alox12e, Arachidonate 12-lipoxygenase, epidermal-type, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alox12eP55249 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Alox12eP55249 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Alox12eP55249 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Alox12eP55249 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Alox12eP55249 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Alox12eP55249 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Alox12eP55249 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Alox12eP55249 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Alox12eP55249 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Alox12eP55249 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Alox12eP55249 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Alox12eP55249 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Alox12eP55249 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Alox12eP55249 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Alox12eP55249 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Alox12eP55249 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Alox12eP55249 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Alox12eP55249 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Alox12eP55249 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Alox12eP55249 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Alox12eP55249 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Alox12eP55249 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Alox12eP55249 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Alox12eP55249 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Alox12eP55249 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Alox12eP55249 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Alox12eP55249 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alox12eP55249 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alox12eP55249 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Alox12eP55249 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alox12eP55249 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Alox12eP55249 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Alox12eP55249 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alox12eP55249 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Alox12eP55249 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Alox12eP55249 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Alox12eP55249 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Alox12eP55249 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alox12eP55249 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Alox12eP55249 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Alox12eP55249 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Alox12eP55249 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Alox12eP55249 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Alox12eP55249 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Alox12eP55249 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alox12eP55249 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alox12eP55249 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alox12eP55249 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alox12eP55249 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alox12eP55249 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Alox12eP55249 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Alox12eP55249 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alox12eP55249 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Alox12eP55249 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alox12eP55249 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Alox12eP55249 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Alox12eP55249 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Alox12eP55249 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Alox12eP55249 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Alox12eP55249 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Alox12eP55249 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Alox12eP55249 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Alox12eP55249 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Alox12eP55249 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Alox12eP55249 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Alox12eP55249 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Alox12eP55249 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Alox12eP55249 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Alox12eP55249 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Alox12eP55249 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Alox12eP55249 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Alox12eP55249 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Alox12eP55249 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Alox12eP55249 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alox12eP55249 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Alox12eP55249 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Alox12eP55249 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Alox12eP55249 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Alox12eP55249 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Alox12eP55249 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Alox12eP55249 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Alox12eP55249 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Alox12eP55249 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Alox12eP55249 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Alox12eP55249 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Alox12eP55249 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Alox12eP55249 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Alox12eP55249 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Alox12eP55249 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Alox12eP55249 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Alox12eP55249 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Alox12eP55249 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Alox12eP55249 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Alox12eP55249 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Alox12eP55249 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Alox12eP55249 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Alox12eP55249 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Alox12eP55249 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alox12eP55249 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Alox12eP55249 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6.8 ms