Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
Best1O88870 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Best1O88870 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Best1O88870 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Best1O88870 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Best1O88870 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Best1O88870 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Best1O88870 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Best1O88870 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Best1O88870 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Best1O88870 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Best1O88870 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Best1O88870 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Best1O88870 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Best1O88870 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Best1O88870 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Best1O88870 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Best1O88870 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Best1O88870 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Best1O88870 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Best1O88870 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Best1O88870 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Best1O88870 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Best1O88870 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Best1O88870 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Best1O88870 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Best1O88870 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Best1O88870 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Best1O88870 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Best1O88870 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Best1O88870 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Best1O88870 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Best1O88870 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Best1O88870 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Best1O88870 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Best1O88870 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Best1O88870 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Best1O88870 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Best1O88870 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Best1O88870 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Best1O88870 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Best1O88870 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Best1O88870 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Best1O88870 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Best1O88870 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Best1O88870 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Best1O88870 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Best1O88870 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Best1O88870 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Best1O88870 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Best1O88870 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Best1O88870 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Best1O88870 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Best1O88870 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Best1O88870 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Best1O88870 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Best1O88870 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Best1O88870 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Best1O88870 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Best1O88870 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Best1O88870 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Best1O88870 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Best1O88870 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Best1O88870 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Best1O88870 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Best1O88870 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Best1O88870 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Best1O88870 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Best1O88870 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Best1O88870 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Best1O88870 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Best1O88870 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Best1O88870 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Best1O88870 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Best1O88870 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Best1O88870 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Best1O88870 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Best1O88870 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Best1O88870 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Best1O88870 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Best1O88870 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Best1O88870 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Best1O88870 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Best1O88870 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Best1O88870 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Best1O88870 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Best1O88870 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Best1O88870 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Best1O88870 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Best1O88870 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Best1O88870 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Best1O88870 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Best1O88870 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Best1O88870 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Best1O88870 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Best1O88870 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Best1O88870 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Best1O88870 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Best1O88870 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Best1O88870 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7 ms