RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A0A1L1SQF0 893 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dapk3O54784 448 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ulbp1Q8HWA3 334 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MbipQ99LQ1 341 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 MicalclQ9D5U9 680 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Naa16Q9DBB4 864 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Suclg2Q9Z2I8 433 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa18.42■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dctn1O08788 1281 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grin1P35438 938 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vps33aQ9D2N9 598 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm28047Q3US59 414 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt1a6Q64435 531 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ift122Q6NWV3 1182 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam160b2Q80YR2 744 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Evc2Q8K1G2 1220 aa18.41■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm10134F6ZQC6 126 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ovgp1Q62010 721 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prdm4Q80V63 803 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Amigo3Q8C2S7 508 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DonsonQ9QXP4 560 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atp1a4Q9WV27 1032 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb1Q91VL9 713 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Map9Q3TRR0 646 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bola3Q8CEI1 110 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ankrd1Q9CR42 319 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vnn1Q9Z0K8 512 aa18.4■□□□□ 0.54
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tfcp2Q9ERA0 502 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myo1bP46735 1107 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pex1Q5BL07 1284 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q8CEZ4 452 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sik3Q6P4S6 1311 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt39Q6IFX4 482 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Creld2Q9CYA0 350 aa18.39■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gdap1l1Q8VE33 370 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ddx60E9PZQ1 1711 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc121E9Q6D3 323 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pde6aP27664 859 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc34Q3UI66 367 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ncoa7Q6DFV7 943 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tubgcp2Q921G8 905 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grin2dQ03391 1323 aa18.38■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Myl3P09542 204 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epc1Q8C9X6 813 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ints4Q8CIM8 964 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nek9Q8K1R7 984 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pold4Q9CWP8 107 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 CpvlQ9D3S9 478 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt24A1L317 512 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Trim34bJ3QNR8 485 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ess2O70279 479 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ranbp1P34022 203 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cdc37Q61081 379 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf771Q8BJ90 317 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Miga2Q8BK03 593 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rbm43Q99J64 343 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 C87499Q3UX49 493 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Prl2c1Q5SVL9 228 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pcdhb14Q6PB90 796 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dusp9Q7TNL7 452 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Haus7Q8BKT8 364 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Spata32Q8C5V0 334 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Krt84Q99M73 603 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Lonrf3Q9D4H7 753 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Chaf1aQ9QWF0 911 aa18.37■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tns2Q8CGB6 1400 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Casp1P29452 402 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Epha2Q03145 977 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zbtb38Q3LR78 1197 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tab2Q99K90 693 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bicdl1A0JNT9 577 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Sdc2P43407 202 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp49Q6P9L4 685 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ciao1Q99KN2 339 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5624F6ZZG8 207 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Capn2O08529 700 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc4a4O88343 1079 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glis3Q6XP49 780 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Dcaf5Q80T85 946 aa18.36■□□□□ 0.53
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Otop3Q80UF9 577 aa18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.3 ms